Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Przewidywanie struktury białek i dużych kompleksów białek w oparciu niskiej rozdzielczości i/lub fragmentaryczne dane eksperymentalne.

2011/01/D/NZ2/07683

Słowa kluczowe:

biologia strukturalna struktura biokompleksów więzy eksperymentalne SAXS NMR

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ1_4: Biologia strukturalna

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna, m.in.:

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Dominik Gront 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 358 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-07

Czas trwania projektu: 36 miesięcy

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. macierz dyskowa. Za kwotę 24 529 PLN
  2. switch + zasilacz awaryjny. Za kwotę 2 132 PLN
  3. oprogramowanie naukowe. Za kwotę 11 119 PLN
  4. Rozbudowa klastra o nowe węzły obliczeniowe (2 szt.). Za kwotę 83 478 PLN
  5. komputer stacjonarny (3 szt.). Za kwotę 13 740 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
  1. BioShell Threader: protein homology detection based on sequence profiles and secondary structure profiles IF: 8,278
    Autorzy:
    Dominik Gront*, Maciej Blaszczyk, Piotr Wojciechowski and Andrzej Kolinski
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2012, tom: W1, strony: 06.01.2019), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1093/nar/gks555 - link do publikacji
  2. BioShell-Threading: Versatile Monte Carlo package for protein 3D threading IF: 3,02
    Autorzy:
    Pawel Gniewek, Andrzej Kolinski, Andrzej Kloczkowski and Dominik Gront
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2012, tom: brak, strony: 0), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1186/1471-2105-15-22 - link do publikacji
  3. Improving thermal stability of thermophilic L-threonine aldolase from Thermatoga maritima IF: 2,884
    Autorzy:
    Lukasz Wieteska, Maksim Ionov, Janusz Szemraj, Andrzej Kolinski, Claudia Feller and Dominik Gront
    Czasopismo:
    Journal of Biotechnology (rok: 2015, tom: 199, strony: 69-76), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1016/j.jbiotec.2015.02.013 - link do publikacji
  1. MECHANICAL UNFOLDING OF DDFLN4 STUDIED BY COARSE-GRAINED KNOWLEDGE-BASED CABS MODEL
    Autorzy:
    MAKSIM KOUZA, MICHAL JAMROZ, DOMINIK GRONT, SEBASTIAN KMIECIK AND ANDRZEJ KOLINSKI
    Konferencja:
    From Computational Biology to Structural Biology (rok: 2014, ), Wydawca: TASK Quarterly
    Data:
    konferencja 25-27 maja
    Status:
    Opublikowane
  2. IMPLEMENTATION AND EVALUATION OF NEW PROTOCOL FOR COMPARATIVE MODELING OF PROTEIN STRUCTURES
    Autorzy:
    M. STRUMILLO, A. E. DAWID, A. SZCZASIUK AND D. GRONT
    Konferencja:
    From Computational Biology to Structural Biology (rok: 2014, ), Wydawca: TASK Quaterly
    Data:
    konferencja 25–27 maja
    Status:
    Opublikowane