Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Uczenie statystyczne wolnych zmiennych kolektywnych z symulacji atomistycznych

2021/43/D/ST4/00920

Słowa kluczowe:

zmienne kolektywne dynamika molekularna wzmocnione próbkowanie uczenie statystyczne

Deskryptory:

  • ST4_4: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
  • ST3_16: Fizyka układów biologicznych
  • ST3_15: Fizyka statystyczna fazy skondensowanej, przejścia fazowe, szum i fluktuacje itp.

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Jakub Rydzewski 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: SONATA 17 - ogłoszony 2021-09-15

Przyznana kwota: 769 200 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2022-07-11

Zakończenie projektu: 2026-07-10

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  1. Reweighted Manifold Learning of Collective Variables from Enhanced Sampling Simulations
    Autorzy:
    Jakub Rydzewski, Ming Chen, Tushar Ghosh, Omar Valsson
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2022, tom: 18, strony: 7179–7192), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jctc.2c00873 - link do publikacji
  2. Manifold Learning in Atomistic Simulations: A Conceptual Review
    Autorzy:
    Jakub Rydzewski, Ming Chen, Omar Valsson
    Czasopismo:
    Machine Learning: Science and Technology (rok: 2023, tom: 4, strony: 31001), Wydawca: IOP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/2632-2153/ace81a - link do publikacji
  3. Selecting High-Dimensional Representations of Physical Systems by Reweighted Diffusion Maps
    Autorzy:
    Jakub Rydzewski
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry Letters (rok: 2023, tom: 14, strony: 2778–2783), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpclett.3c00265 - link do publikacji
  4. Spectral map: Embedding slow kinetics in collective variables
    Autorzy:
    Jakub Rydzewski
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry Letters (rok: 2023, tom: 14, strony: 5216–5220), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpclett.3c01101 - link do publikacji