Rozwój metod wykrywania CNV opartych na głębokości pokrycia
2019/35/N/ST6/01983
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST6_013: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- ST6_006: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier
- NZ2_007: Bioinformatyka
Panel
ST6 – Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne
Jednostka realizująca
Politechnika Warszawska
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs
PRELUDIUM 18 – ogłoszony 2019-09-16
- Przyznana kwota
- 136 800 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2020-07-09
- Zakończenie projektu
- 2024-07-08
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (3)
-
Estimated Nucleotide Reconstruction Quality Symbols of Basecalling Tools for Oxford Nanopore Sequencing
- Autorzy:
- Wiktor Kuśmirek
- Czasopismo:
- Sensors (rok: 2023, tom: 23, strony: 6787), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/s23156787 – link do publikacji
-
CNVind: an open source cloud-based pipeline for rare CNVs detection in whole exome sequencing data based on the depth of coverage
- Autorzy:
- Wiktor Kuśmirek, Robert Nowak
- Czasopismo:
- BMC Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: 46038), Wydawca: BioMed Central (BMC)
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s12859‑022‑04617‑x – link do publikacji
-
Different Strategies for Counting the Depth of Coverage in Copy Number Variation Calling Tools
- Autorzy:
- Wiktor Kuśmirek
- Czasopismo:
- Bioinformatics and Biology Insights (rok: 2022, tom: 16, strony: 46031), Wydawca: SAGE Publications
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1177/11779322221115534 – link do publikacji