Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Rozwój metod wykrywania CNV opartych na głębokości pokrycia

2019/35/N/ST6/01983

Słowa kluczowe:

sekwencjonowanie pełnoeksomowe zmiana liczby kopii głębokość pokrycia

Deskryptory:

  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • ST6_6: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Warszawska

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Wiktor Tomasz Kuśmirek 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 18 - ogłoszony 2019-09-16

Przyznana kwota: 136 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2020-07-09

Zakończenie projektu: 2024-07-08

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Estimated Nucleotide Reconstruction Quality Symbols of Basecalling Tools for Oxford Nanopore Sequencing
    Autorzy:
    Wiktor Kuśmirek
    Czasopismo:
    Sensors (rok: 2023, tom: 23, strony: 6787), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/s23156787 - link do publikacji
  2. Estimated Nucleotide Reconstruction Quality Symbols of Basecalling Tools for Oxford Nanopore Sequencing
    Autorzy:
    Wiktor Kuśmirek
    Czasopismo:
    Sensors (rok: 2023, tom: 23, strony: 6787), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/s23156787 - link do publikacji
  3. CNVind: an open source cloud-based pipeline for rare CNVs detection in whole exome sequencing data based on the depth of coverage
    Autorzy:
    Wiktor Kuśmirek, Robert Nowak
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: 45673), Wydawca: BioMed Central (BMC)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12859‑022‑04617‑x - link do publikacji
  4. Different Strategies for Counting the Depth of Coverage in Copy Number Variation Calling Tools
    Autorzy:
    Wiktor Kuśmirek
    Czasopismo:
    Bioinformatics and Biology Insights (rok: 2022, tom: 16, strony: 45666), Wydawca: SAGE Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1177/11779322221115534 - link do publikacji
  5. CNVind: an open source cloud-based pipeline for rare CNVs detection in whole exome sequencing data based on the depth of coverage
    Autorzy:
    Wiktor Kuśmirek, Robert Nowak
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: 45673), Wydawca: BioMed Central (BMC)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12859‑022‑04617‑x - link do publikacji
  6. Different Strategies for Counting the Depth of Coverage in Copy Number Variation Calling Tools
    Autorzy:
    Wiktor Kuśmirek
    Czasopismo:
    Bioinformatics and Biology Insights (rok: 2022, tom: 16, strony: 45666), Wydawca: SAGE Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1177/11779322221115534 - link do publikacji
  7. Different Strategies for Counting the Depth of Coverage in Copy Number Variation Calling Tools
    Autorzy:
    Wiktor Kuśmirek
    Czasopismo:
    Bioinformatics and Biology Insights (rok: 2022, tom: 16, strony: 45666), Wydawca: SAGE Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1177/11779322221115534 - link do publikacji
  8. CNVind: an open source cloud-based pipeline for rare CNVs detection in whole exome sequencing data based on the depth of coverage
    Autorzy:
    Wiktor Kuśmirek, Robert Nowak
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: 45673), Wydawca: BioMed Central (BMC)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12859‑022‑04617‑x - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy