Projekty finansowane przez NCN
Rozwój i zastosowanie metod identyfikacji oddziałujących molekuł na podstawie analizy koewolucji sekwencji.
2018/29/N/NZ2/02897
Słowa kluczowe:
Bialka RNA analiza sekwencji Direct Coupling Analysis DCA paralogi interacja
Deskryptory:
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- NZ2_9: Biologia systemowa
- NZ2_3: Proteomika
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs: PRELUDIUM 15 - ogłoszony 2018-03-15
Przyznana kwota: 138 100 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2019-03-06
Zakończenie projektu: 2021-03-05
Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Serwer. Za kwotę 18 771 PLN
- Serwer obliczeniowy. Za kwotę 25 000 PLN
- Komputer przenośny. Za kwotę 6 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Knot_pull—python package for biopolymer smoothing and knot detectionAutorzy:Aleksandra I Jarmolinska, Anna Gambin, Joanna I SulkowskaCzasopismo:Bioinformatics (rok: 2020, tom: 36, strony: 953-955), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/bioinformatics/btz644 - link do publikacji
- Slipknotted and unknotted monovalent cation-proton antiporters evolved from a common ancestorAutorzy:Vasilina Zayats,Agata P. Perlinska,Aleksandra I. Jarmolinska,Borys Jastrzebski,Stanislaw Dunin-Horkawicz,Joanna I. SulkowskaCzasopismo:Plos Computational Biology (rok: 2021, tom: 17, strony: 45311), Wydawca: PlosStatus:OpublikowanaDoi:10.1371/journal.pcbi.1009502 - link do publikacji