Projekty finansowane przez NCN
Identyfikacja i adnotacja funkcjonalna taksonomicznie-specyficznych genów bakterii
2017/25/B/NZ2/00187
Słowa kluczowe:
geny homologiczne genomika bakterie bioinformatyka
Deskryptory:
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15
Przyznana kwota: 816 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2018-01-01
Zakończenie projektu: 2022-12-23
Planowany czas trwania projektu: 59 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Komputer przenośny typu MacBook Pro (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN
- Zasilacz awaryjny. Za kwotę 6 814 PLN
- Internetowy serwer komputerowy. Za kwotę 120 000 PLN
- Wysokiej klasy stacja robocza (2 szt.). Za kwotę 60 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (4)
- Taxonomically Restricted Genes in Bacillus may form clusters of homologs and can be traced to a large reservoir of noncoding sequencesAutorzy:Karlowski W.M., Varshney D., Zielezinski A.Czasopismo:Genome Biology and Evolution (rok: 2023, tom: -, strony: -), Wydawca: Oxford University PressStatus:Przyjęta do publikacjiDoi:10.1093/gbe/evad023 - link do publikacji
- Massive annotation of bacterial L-asparaginases reveals their puzzling distribution and frequent gene transfer eventsAutorzy:Zielezinski A., Loch J.I., Karlowski W.M., Jaskolski M.Czasopismo:Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12, strony: 15797), Wydawca: Springer NatureStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/s41598-022-19689-1 - link do publikacji
- Benchmarking of alignment-free sequence comparison methodsAutorzy:Zielezinski, A., Girgis, H.Z., Bernard, G., Leimeister, C.-A., Tang, K., Dencker, T., Lau, A.K., Röhling, S., Choi, J.J., Waterman, M.S., Comin, M., Kim, S.-H., Vinga, S., Almeida, J.S., Chan, C.X., James, B.T., Sun, F., Morgenstern, B., Karlowski, W.M.Czasopismo:Genome Biology (rok: 2019, tom: 20 (1), strony: 144), Wydawca: Springer NatureStatus:OpublikowanaDoi:10.1186/s13059-019-1755-7 - link do publikacji
- TRGdb: a universal resource for exploration of taxonomically restricted genes in bacteriaAutorzy:Zielezinski A., Dobrychlop W., Karlowski W.MCzasopismo:Briefings in Bioinformatics (rok: 2023, tom: -, strony: -), Wydawca: Oxford University PressStatus:ZłożonaDoi:brak - link do publikacji