Identyfikacja i adnotacja funkcjonalna taksonomicznie-specyficznych genów bakterii
2017/25/B/NZ2/00187
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
dr hab. Wojciech Maciej Karłowski
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs
OPUS 13 – ogłoszony 2017-03-15
- Przyznana kwota
- 816 000 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2018-01-24
- Zakończenie projektu
- 2022-12-23
- Planowany czas trwania projektu
- 59 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Internetowy serwer komputerowy. Za kwotę 120 000 PLN
- Komputer przenośny typu MacBook Pro (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN
- Wysokiej klasy stacja robocza (2 szt.). Za kwotę 60 000 PLN
- Zasilacz awaryjny. Za kwotę 6 814 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (3)
-
Massive annotation of bacterial L-asparaginases reveals their puzzling distribution and frequent gene transfer events
- Autorzy:
- Zielezinski A., Loch J.I., Karlowski W.M., Jaskolski M.
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12, strony: 15797), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-022-19689-1 – link do publikacji
-
Benchmarking of alignment-free sequence comparison methods
- Autorzy:
- Zielezinski, A., Girgis, H.Z., Bernard, G., Leimeister, C.-A., Tang, K., Dencker, T., Lau, A.K., Röhling, S., Choi, J.J., Waterman, M.S., Comin, M., Kim, S.-H., Vinga, S., Almeida, J.S., Chan, C.X., James, B.T., Sun, F., Morgenstern, B., Karlowski, W.M.
- Czasopismo:
- Genome Biology (rok: 2019, tom: 20 (1), strony: 144), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s13059-019-1755-7 – link do publikacji
-
Taxonomically Restricted Genes in Bacillus may form clusters of homologs and can be traced to a large reservoir of noncoding sequences
- Autorzy:
- Karlowski W.M., Varshney D., Zielezinski A.
- Status:
- Przyjęta do publikacji