Projekty finansowane przez NCN
Synteza i badania strukturalne oligonukleotydów o sekwencjach ramion antykodonów tRNA zawierających nowe modyfikowane nukleozydy: ct6A, ms2ct6A, ges2U
2017/25/B/ST5/00971
Słowa kluczowe:
modyfikowane nukleozydy tRNA synteza oligorybonukleotydów geranylowe 2-tiourydyny modyfikowane adenozyny ct6A ms2ct6A struktura RNA biomolekularna spektroskopia NMR,
Deskryptory:
- ST5_16: Chemia biologiczna
- ST5_23: Chemia organiczna
Panel:
ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna
Jednostka realizująca:
Politechnika Łódzka, Wydział Chemiczny
woj. łódzkie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 9
Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15
Przyznana kwota: 1 390 200 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2018-02-01
Zakończenie projektu: 2022-02-20
Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- pompa próżniowa. Za kwotę 10 000 PLN
- Zestaw HPLC. Za kwotę 340 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (7)
- New efficient synthesis of tRNA related adenosines bearing the hydantoin ring (ct6A, ms2ct6A) by intramolecular cyclization of N6-Boc-α-aminoacyl)adenosine derivatives-Autorzy:Katarzyna Frankowska, Elżbieta SochackaCzasopismo:ChemBioChem (rok: 2022, tom: 23, strony: e2002100655), Wydawca: Wiley-VCH GmbHStatus:OpublikowanaDoi:10.1002/cbic.202100655 - link do publikacji
- Chemical synthesis of oligoribonucleotide (ASL of tRNALys T.brucei) containing a recently discovered cyclic form of 2-methylthio-N6-threonylcarbamoyladenosine (ms2ct6A)Autorzy:Debiec K, Matuszewski M, Podskoczyj K, Leszczynska G, Sochacka E.Czasopismo:Chemistry, A European Journal (rok: 2019, tom: 25, strony: 13309-13317), Wydawca: Wiley – VCHStatus:OpublikowanaDoi:10.1002/chem.201902411 - link do publikacji
- Synthesis of nucleobase-modified RNA oligonucleotides by post-synthetic approachAutorzy:Karolina Bartosik, Katarzyna Debiec, Anna Czarnecka, Elzbieta Sochacka, grazyna LeszczynskaCzasopismo:Molecules (rok: 2020, tom: 25, strony: 3344), Wydawca: MDPIStatus:OpublikowanaDoi:10.3390/molecules25153344 - link do publikacji
- Efficient access to 3'-O-phosphoramidite derivatives of tRNA related N6-threonylcarbamoyladenosine (t6A) and 2-methylthio-N6-threonylcarbamoyladenosine (ms2t6A)Autorzy:Katarzyna Debiec, Elzbieta SochackaCzasopismo:RSC Advances (rok: 2021, tom: 11, strony: 1992-1999), Wydawca: Royal Society of ChemistryStatus:OpublikowanaDoi:10.1039/d0ra09803e - link do publikacji
- Computational and NMR studies of RNA duplexes with an internal pseudouridine-adenosine base pairAutorzy:Indrajit Deb, Łukasz Popenda, Joanna Sarzyńska, Magdalena Małgowska, Ansuman Lahiri, Zofia Gdaniec, Ryszard KierzekCzasopismo:Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 16278), Wydawca: Nature Publishing GroupStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/s41598-019-52637-0 - link do publikacji
- Nano LC-MS using capillary columns enables accurate quantification of modified ribonucleosides at low femtomol levelsAutorzy:L. P. Sarin, S. D. Kienast, J. Leufken, R. L. Ross, A. Dziergowska, K. Debiec, E. Sochacka, P. A. Limbach,Czasopismo:RNA (rok: 2018, tom: 24, strony: 1403-1417), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1261/rna.065482.117 - link do publikacji
- Thermodynamic and structural contributions of the 6-thioguanosine residue to helical properties of RNAAutorzy:Michał Gładysz, Witold Andrałojć , Tomasz Czapik , Zofia Gdaniec, Ryszard KierzekCzasopismo:Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 4385), Wydawca: Nature Publishing GroupStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/s41598-019-40715-2 - link do publikacji