Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Synteza i badania strukturalne oligonukleotydów o sekwencjach ramion antykodonów tRNA zawierających nowe modyfikowane nukleozydy: ct6A, ms2ct6A, ges2U

2017/25/B/ST5/00971

Słowa kluczowe:

modyfikowane nukleozydy tRNA synteza oligorybonukleotydów geranylowe 2-tiourydyny modyfikowane adenozyny ct6A ms2ct6A struktura RNA biomolekularna spektroskopia NMR,

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_23: Chemia organiczna

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Politechnika Łódzka, Wydział Chemiczny

woj. łódzkie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Elżbieta Sochacka 

Liczba wykonawców projektu: 9

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 1 390 200 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-02-21

Zakończenie projektu: 2022-02-20

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Zestaw HPLC. Za kwotę 340 000 PLN
  2. pompa próżniowa. Za kwotę 10 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  1. Computational and NMR studies of RNA duplexes with an internal pseudouridine-adenosine base pair
    Autorzy:
    Indrajit Deb, Łukasz Popenda, Joanna Sarzyńska, Magdalena Małgowska, Ansuman Lahiri, Zofia Gdaniec, Ryszard Kierzek
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 16278), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-52637-0 - link do publikacji
  2. Chemical synthesis of oligoribonucleotide (ASL of tRNALys T.brucei) containing a recently discovered cyclic form of 2-methylthio-N6-threonylcarbamoyladenosine (ms2ct6A)
    Autorzy:
    Debiec K, Matuszewski M, Podskoczyj K, Leszczynska G, Sochacka E.
    Czasopismo:
    Chemistry, A European Journal (rok: 2019, tom: 25, strony: 13309-13317), Wydawca: Wiley – VCH
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.201902411 - link do publikacji
  3. Nano LC-MS using capillary columns enables accurate quantification of modified ribonucleosides at low femtomol levels
    Autorzy:
    L. P. Sarin, S. D. Kienast, J. Leufken, R. L. Ross, A. Dziergowska, K. Debiec, E. Sochacka, P. A. Limbach,
    Czasopismo:
    RNA (rok: 2018, tom: 24, strony: 1403-1417), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1261/rna.065482.117 - link do publikacji
  4. New efficient synthesis of tRNA related adenosines bearing the hydantoin ring (ct6A, ms2ct6A) by intramolecular cyclization of N6-Boc-α-aminoacyl)adenosine derivatives-
    Autorzy:
    Katarzyna Frankowska, Elżbieta Sochacka
    Czasopismo:
    ChemBioChem (rok: 2022, tom: 23, strony: e2002100655), Wydawca: Wiley-VCH GmbH
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cbic.202100655 - link do publikacji
  5. Synthesis of nucleobase-modified RNA oligonucleotides by post-synthetic approach
    Autorzy:
    Karolina Bartosik, Katarzyna Debiec, Anna Czarnecka, Elzbieta Sochacka, grazyna Leszczynska
    Czasopismo:
    Molecules (rok: 2020, tom: 25, strony: 3344), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/molecules25153344 - link do publikacji
  6. Efficient access to 3'-O-phosphoramidite derivatives of tRNA related N6-threonylcarbamoyladenosine (t6A) and 2-methylthio-N6-threonylcarbamoyladenosine (ms2t6A)
    Autorzy:
    Katarzyna Debiec, Elzbieta Sochacka
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2021, tom: 11, strony: 1992-1999), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d0ra09803e - link do publikacji
  7. Thermodynamic and structural contributions of the 6-thioguanosine residue to helical properties of RNA
    Autorzy:
    Michał Gładysz, Witold Andrałojć , Tomasz Czapik , Zofia Gdaniec, Ryszard Kierzek
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 4385), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-40715-2 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy