Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Identyfikacja i charakteryzacja białek o topologii splotu.

2016/21/N/NZ1/02848

Słowa kluczowe:

białka topologia sploty węzły symulacje

Deskryptory:

  • NZ1_3: Biofizyka
  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • ST1_6: Topologia

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Paweł Dąbrowski-Tumański 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: PRELUDIUM 11 - ogłoszony 2016-03-15

Przyznana kwota: 100 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-01-24

Zakończenie projektu: 2019-10-23

Planowany czas trwania projektu: 33 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Serwer obliczeniowy. Za kwotę 22 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  1. Genus trace reveals the topological complexity and domain structure of biomolecules
    Autorzy:
    Zajac S, Geary C, Andersen ES, Dabrowski-Tumanski P, Sulkowska JI, Sułkowski P
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2018, tom: 8, strony: 17537), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-018-35557-3 - link do publikacji
  2. KnotProt 2.0: a database of proteins with knots and other entangled structures
    Autorzy:
    Dabrowski-Tumanski P, Rubach P, Goundaroulis D, Dorier J, Sułkowski P, Millett KC, Rawdon EJ, Stasiak A, Sulkowska JI
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2018, tom: 47, strony: D367-D375), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gky1140 - link do publikacji
  3. To Tie or Not to Tie? That Is the Question
    Autorzy:
    Pawel Dabrowski-Tumanski, Joanna I. Sulkowska
    Czasopismo:
    Polymers (rok: 2017, tom: 9, strony: 454), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/polym9090454 - link do publikacji
  4. PyLink: a PyMOL plugin to identify links
    Autorzy:
    Gierut A, Dabrowski-Tumanski P, Niemyska W, Millett KC, Sulkowska JI
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2019, tom: bty1038, strony: bty1038), Wydawca: Oxford University Press}
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/bty1038 - link do publikacji
  5. GapRepairer–a server to model a structural gap and validate it using topological analysis
    Autorzy:
    Jarmolinska AI, Kadlof M, Dabrowski-Tumanski P, Sulkowska JI
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2018, tom: 34, strony: 3300-3307), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/bty334 - link do publikacji
  6. Protein Knotting by Active Threading of Nascent Polypeptide Chain Exiting From the Ribosome Exit Channel
    Autorzy:
    Dabrowski-Tumanski P, Piejko M, Niewieczerzal S, Stasiak A, Sulkowska JI
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2018, tom: 122, strony: 11616-11625), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.8b07634 - link do publikacji
  7. PyLasso: a PyMOL plugin to identify lassos
    Autorzy:
    Aleksandra M Gierut, Wanda Niemyska, Pawel Dabrowski-Tumanski, Piotr Sułkowski, Joanna I Sulkowska
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2017, tom: 33, strony: 3819–3821), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btx493 - link do publikacji
  8. Statistical Properties of Lasso-Shape Polymers and Their Implications for Complex Lasso Proteins Function
    Autorzy:
    Pawel, Dabrowski-Tumanski, Bartosz Gren, Joanna I Sulkowska
    Czasopismo:
    Polymers (rok: 2019, tom: 11, strony: 707), Wydawca: MDPI, ST ALBAN-ANLAGE 66, CH-4052 BASEL, SWITZERLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/polym11040707 - link do publikacji
  9. The exclusive effects of chaperonin on the behavior of proteins with 52 knot
    Autorzy:
    Zhao Y, Dabrowski-Tumanski P, Niewieczerzal S, Sulkowska JI
    Czasopismo:
    PLoS Computational Biology (rok: 2018, tom: 14, strony: e1005970), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pcbi.1005970 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy