Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Rekonstrukcja ścieżek dyfuzji liganda z białka

2016/20/T/ST3/00488

Słowa kluczowe:

Deskryptory:

  • ST3_4: Transport w materii skondensowanej
  • ST3_17: Fizyka statystyczna (materii skondensowanej)
  • NZ1_3: Biofizyka

Panel:

ST3 - Fizyka fazy skondensowanej: struktura, własności elektronowe, płyny, nano-nauka

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

woj. kujawsko-pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Jakub Rydzewski 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: ETIUDA 4 - ogłoszony 2015-12-15

Przyznana kwota: 91 352 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-10-01

Zakończenie projektu: 2017-09-30

Planowany czas trwania projektu: 12 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (5)
  1. Rare-event sampling in ligand diffusion: Reply to comments on Ligand diffusion in proteins via enhanced sampling in molecular dynamics" IF: 13,783
    Autorzy:
    J. Rydzewski, W. Nowak
    Czasopismo:
    Physics of Life Reviews (rok: 2017, tom: 22-23, strony: 85-87), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.plrev.2017.08.011 - link do publikacji
  2. Kinetics of Huperzine A Dissociation from Acetylcholinesterase via Multiple Unbinding Pathways IF: 5,399
    Autorzy:
    J. Rydzewski , R. Jakubowski, W. Nowak, and H. Grubmüller
    Czasopismo:
    J. Chem. Theory Comput. (rok: 2018, tom: 14, strony: 2843-2851), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jctc.8b00173 - link do publikacji
  3. Thermodynamics of camphor migration in cytochrome P450cam by atomistic simulations IF: 4,122
    Autorzy:
    J. Rydzewski & W. Nowak
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: 7736), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-017-07993-0 - link do publikacji
  4. maze: Heterogeneous ligand unbinding along transient protein tunnels IF: 3,627
    Autorzy:
    Jakub Rydzewski
    Czasopismo:
    Computer Physics Communications (rok: 2020, tom: 247, strony: 106865), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.cpc.2019.106865 - link do publikacji
  5. Ligand diffusion in proteins via enhanced sampling in molecular dynamics IF: 13,783
    Autorzy:
    J Rydzewski, W Nowak
    Czasopismo:
    Physics of Life Reviews (rok: 2017, tom: 22-23, strony: 58-74), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.plrev.2017.03.003 - link do publikacji