Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Charakterystyka kosmopolitycznych szczepów bakterii z rodzaju Pectobacterium (patogenów roślin) - identyfikacja genów związanych z adaptacją środowiskową, szybkim rozprzestrzenianiem się oraz zmianą rośliny żywicielskiej

2015/17/B/NZ9/01730

Słowa kluczowe:

patogeny roślin adaptacja środowiskowa genotyp fenotyp trankryptom rekombinacja mutageneza testy komplementacji

Deskryptory:

  • NZ9_8: Mikrobiologia środowiskowa
  • NZ1_10: Biologia drobnoustrojów
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika

Panel:

NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Gdański, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Małgorzata Waleron 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: OPUS 9 - ogłoszony 2015-03-16

Przyznana kwota: 643 120 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-01-01

Zakończenie projektu: 2020-01-24

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Platforma obliczeniowa - komputer do obsługi programów bioinformatycznych.. Za kwotę 14 899 PLN
  2. Elektroporator. Za kwotę 52 000 PLN
  3. Zestaw termomikiserów do płytek 96 dołkowych i probówek typu Eppendorf. Za kwotę 30 000 PLN
  4. Licencje i aktualizacje programów bioinformatycznych (CLC Genomic WorkBench, Geneious i in.). Za kwotę 33 000 PLN
  5. Monitor do platformy obliczeniowej. Za kwotę 742 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Pectobacterium parvum sp. nov., having a Salmonella SPI-1-like Type III secretion system and low virulence
    Autorzy:
    Miia Pasanen, Malgorzata Waleron, Thomas Schott, Ilse Cleenwerck, Agnieszka Misztak, Krzysztof Waleron, Leighton Pritchard, Ramadan Bakr, Yeshitila Degefu, Jan van der Wolf, Peter Vandamme, Minna Pirhonen
    Czasopismo:
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (rok: 2020, tom: 70, strony: ijsem004057), Wydawca: Microbiology Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1099/ijsem.0.004057 - link do publikacji
  2. Pectobacterium zantedeschiae sp. nov. a new species of a soft rot pathogen isolated from Calla lily (Zantedeschiae spp.).
    Autorzy:
    Malgorzata Waleron; Agnieszka E Misztak; Michal M Waleron; Bartosz Wielgomas, Artur Mikiciński, Krzysztof Waleron
    Czasopismo:
    Systematic and Applied Microbiology (rok: 2019, tom: brak, strony: brak), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.syapm.2018.08.004 - link do publikacji
  3. Pectobacterium polonicum sp. nov. isolated from vegetable fields in Northern Poland
    Autorzy:
    M. Waleron, A. Misztak1, M.M. Waleron, J. Jonca, M. Furmaniak, K. Waleron.
    Czasopismo:
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (rok: 2019, tom: 69, strony: 1751-1759), Wydawca: the Microbiology Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1099/ijsem.0.003387 - link do publikacji
  4. Practical considerations in the application of a polypyridyl complex of Ru(II) in physiological and biochemical studies of Pectobacterium spp. and other bacteria
    Autorzy:
    Joanna Jonca, Aneta Stachowska; Agnieszka Chylewska; Katarzyna Turecka; Małgorzata Waleron; Krzysztof Waleron
    Czasopismo:
    Eruropean Journal of Plant Pathology (rok: 2021, tom: 159, strony: 371–383), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10658-020-02168-6 - link do publikacji
  5. First Report of Candidatus Pectobacterium maceratum" Causing Soft Rot of Potato in Poland.
    Autorzy:
    M Waleron, AE Misztak, J Jonca, M Furmaniak, MM Waleron, KF Waleron
    Czasopismo:
    Plant Disease (rok: 2019, tom: 3, strony: 1409-1410), Wydawca: The American Phytopathological Society (APS)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1094/PDIS-10-18-1849-PDN - link do publikacji
  6. Transfer of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum strains isolated from potatoes grown at high altitudes to Pectobacterium peruviense sp. nov.
    Autorzy:
    Malgorzata Waleron, Agnieszka Misztak, Michal Waleron, Martyna Franczuk,Bartosz Wielgomas, Krzysztof Waleron
    Czasopismo:
    Systematic and Applied Microbiology (rok: 2018, tom: 41, strony: 85-93), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.syapm.2017.11.005 - link do publikacji
  7. First Report of Pectobacterium polaris Causing Soft Rot of Potato in Poland.
    Autorzy:
    M Waleron, A Misztak, J Jońca, K Waleron
    Czasopismo:
    Plant Disease (rok: 2018, tom: 103, strony: 144), Wydawca: The American Phytopathological Society (APS)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1094/PDIS-05-18-0861-PDN - link do publikacji
  8. European Population of Pectobacterium punjabense: Genomic Diversity, Tuber Maceration Capacity and a Detection Tool for This Rarely Occurring Potato Pathogen
    Autorzy:
    Cigna,J.;Laurent,A.; Waleron, M.; Waleron, K.; Dewaegeneire, P.; van der Wolf, J.; Andrivon, D.; Faure, D.; Hélias, V.
    Czasopismo:
    Microorganisms (rok: 2021, tom: 9(4), strony: 781), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
  1. Nowe gatunki Pectobacterium i ich występowanie w Polsce.
    Autorzy:
    M Waleron, A Misztak, J Jońca, K Waleron
    Konferencja:
    Aktualne kierunki badań nad chorobami bakteryjnymi roślin w Polsce" (rok: 2018, ), Wydawca: Komitet Nauk Agronomicznych PAN Polskie Towarzystwo Fitopatologiczne, Sekcja Bakteryjnych Chorób Roślin
    Data:
    konferencja 18 października 2018
    Status:
    Opublikowana