Charakterystyka kosmopolitycznych szczepów bakterii z rodzaju Pectobacterium (patogenów roślin) - identyfikacja genów związanych z adaptacją środowiskową, szybkim rozprzestrzenianiem się oraz zmianą rośliny żywicielskiej
2015/17/B/NZ9/01730
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ9_8: Mikrobiologia środowiskowa
- NZ1_10: Biologia drobnoustrojów
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
Panel
NZ9 – Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa
Jednostka realizująca
Uniwersytet Gdański, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego
woj. pomorskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 7
Konkurs
OPUS 9 – ogłoszony 2015-03-16
- Przyznana kwota
- 643 120 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2016-01-25
- Zakończenie projektu
- 2020-01-24
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Elektroporator. Za kwotę 52 000 PLN
- Licencje i aktualizacje programów bioinformatycznych (CLC Genomic WorkBench, Geneious i in.). Za kwotę 33 000 PLN
- Monitor do platformy obliczeniowej. Za kwotę 742 PLN
- Platforma obliczeniowa - komputer do obsługi programów bioinformatycznych.. Za kwotę 14 899 PLN
- Zestaw termomikiserów do płytek 96 dołkowych i probówek typu Eppendorf. Za kwotę 30 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (8)
-
Pectobacterium parvum sp. nov., having a Salmonella SPI-1-like Type III secretion system and low virulence
- Autorzy:
- Miia Pasanen, Malgorzata Waleron, Thomas Schott, Ilse Cleenwerck, Agnieszka Misztak, Krzysztof Waleron, Leighton Pritchard, Ramadan Bakr, Yeshitila Degefu, Jan van der Wolf, Peter Vandamme, Minna Pirhonen
- Czasopismo:
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (rok: 2020, tom: 70, strony: ijsem004057), Wydawca: Microbiology Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1099/ijsem.0.004057 – link do publikacji
-
First Report of Candidatus Pectobacterium maceratum Causing Soft Rot of Potato in Poland.
- Autorzy:
- M Waleron, AE Misztak, J Jonca, M Furmaniak, MM Waleron, KF Waleron
- Czasopismo:
- Plant Disease (rok: 2019, tom: 3, strony: 1409-1410), Wydawca: The American Phytopathological Society (APS)
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1094/PDIS-10-18-1849-PDN – link do publikacji
-
European Population of Pectobacterium punjabense: Genomic Diversity, Tuber Maceration Capacity and a Detection Tool for This Rarely Occurring Potato Pathogen
- Autorzy:
- Cigna,J.;Laurent,A.; Waleron, M.; Waleron, K.; Dewaegeneire, P.; van der Wolf, J.; Andrivon, D.; Faure, D.; Hélias, V.
- Czasopismo:
- Microorganisms (rok: 2021, tom: 9(4), strony: 781), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
-
Pectobacterium polonicum sp. nov. isolated from vegetable fields in Northern Poland
- Autorzy:
- M. Waleron, A. Misztak1, M.M. Waleron, J. Jonca, M. Furmaniak, K. Waleron.
- Czasopismo:
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (rok: 2019, tom: 69, strony: 1751-1759), Wydawca: the Microbiology Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1099/ijsem.0.003387 – link do publikacji
-
Practical considerations in the application of a polypyridyl complex of Ru(II) in physiological and biochemical studies of Pectobacterium spp. and other bacteria
- Autorzy:
- Joanna Jonca, Aneta Stachowska; Agnieszka Chylewska; Katarzyna Turecka; Małgorzata Waleron; Krzysztof Waleron
- Czasopismo:
- Eruropean Journal of Plant Pathology (rok: 2021, tom: 159, strony: 371–383), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s10658-020-02168-6 – link do publikacji
-
Pectobacterium zantedeschiae sp. nov. a new species of a soft rot pathogen isolated from Calla lily (Zantedeschiae spp.).
- Autorzy:
- Malgorzata Waleron; Agnieszka E Misztak; Michal M Waleron; Bartosz Wielgomas, Artur Mikiciński, Krzysztof Waleron
- Czasopismo:
- Systematic and Applied Microbiology (rok: 2019, tom: brak, strony: brak), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.syapm.2018.08.004 – link do publikacji
-
First Report of Pectobacterium polaris Causing Soft Rot of Potato in Poland.
- Autorzy:
- M Waleron, A Misztak, J Jońca, K Waleron
- Czasopismo:
- Plant Disease (rok: 2018, tom: 103, strony: 144), Wydawca: The American Phytopathological Society (APS)
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1094/PDIS-05-18-0861-PDN – link do publikacji
-
Transfer of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum strains isolated from potatoes grown at high altitudes to Pectobacterium peruviense sp. nov.
- Autorzy:
- Malgorzata Waleron, Agnieszka Misztak, Michal Waleron, Martyna Franczuk,Bartosz Wielgomas, Krzysztof Waleron
- Czasopismo:
- Systematic and Applied Microbiology (rok: 2018, tom: 41, strony: 85-93), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.syapm.2017.11.005 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
-
Nowe gatunki Pectobacterium i ich występowanie w Polsce.
- Autorzy:
- M Waleron, A Misztak, J Jońca, K Waleron
- Konferencja:
- Aktualne kierunki badań nad chorobami bakteryjnymi roślin w Polsce (rok: 2018, strony: 39-41), Wydawca: Komitet Nauk Agronomicznych PAN Polskie Towarzystwo Fitopatologiczne, Sekcja Bakteryjnych Chorób Roślin
- Data:
- konferencja 18 października 2018
- Status:
- Opublikowana