Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Modelowanie fragmentacji biomolekuł indukowanej transferem elektronu w spectrometrii mas

2015/17/N/ST6/03565

Słowa kluczowe:

statystyczna dynamika ETD fragmentacja biomolekuł w spektrometrze mas

Deskryptory:

  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Mateusz Łącki 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 9 - ogłoszony 2015-03-16

Przyznana kwota: 93 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-02-17

Zakończenie projektu: 2018-02-16

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Stacja robocza dla obliczeń proteomicznych.. Za kwotę 14 980 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (5)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Conformational space and stability of ETD charge reduction products of ubiquitin
    Autorzy:
    Frederik Lermyte, Mateusz K. Łącki, Dirk Valkenborg, Anna Gambin, Frank Sobott
    Czasopismo:
    Journal of The American Society for Mass Spectrometry (rok: 2017, tom: 28, strony: 69-76), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s13361-016-1444-7 - link do publikacji
  2. Estimation of Rates of Reactions Triggered by Electron Transfer in Top-Down Mass Spectrometry
    Autorzy:
    Michał A. Ciach, Mateusz K. Łącki, Błażej Miasojedow, Frederik Lermyte, Dirk Valkenborg, Frank Sobott, Anna Gambin
    Czasopismo:
    Journal of Computational Biology (rok: 2018, tom: 25, strony: online), Wydawca: Mary Ann Liebert, Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1089/cmb.2017.0156 - link do publikacji
  3. IsoSpec: Hyperfast Fine Structure Calculator
    Autorzy:
    Mateusz K. Łącki, Michał P. Startek, Dirk Valkenborg, Anna Gambin
    Czasopismo:
    Analitical Chemistry (rok: 2017, tom: 89, strony: 3272-3277), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.analchem.6b01459 - link do publikacji
  4. Leaf and plant age affects photosynthetic performance and photoprotective capacity
    Autorzy:
    Ludwik W. Bielczyński, Mateusz K. Łącki, Iris Hoefnagels, Anna Gambin, Roberta Croce
    Czasopismo:
    Plant Physiology (rok: 2017, tom: 175, strony: 1634-1648), Wydawca: American Society of Plant Biologists
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1104/pp.17.00904 - link do publikacji
  5. MassTodon: A tool for assigning peaks and modeling electron transfer reactions in top-down mass spectrometry
    Autorzy:
    Mateusz K. Łącki, Frederik Lermyte, Błażej Miasojedow, Michał Startek, Frank Sobott, Dirk Valkenborg, Anna Gambin
    Czasopismo:
    Analitical Chemistry (rok: 2019, tom: 91, 3, strony: 1801-1807), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.analchem.8b01479 - link do publikacji
  1. May). Estimation of Rates of Reactions Triggered by Electron Transfer in Top- Down Mass Spectrometry.
    Autorzy:
    Michał A. Ciach, Mateusz K. Łącki, Błażej Miasojedow, Frederik Lermyte, Dirk Valkenborg, Frank Sobott, Anna Gambin
    Konferencja:
    International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (rok: 2017, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja 42886
    Status:
    Opublikowana