Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Funkcje regulatorowe długich niekodujących RNA w kontekście oddziaływań RNA:RNA

2014/15/D/NZ2/00525

Słowa kluczowe:

długie niekodujące RNA lncRNA splicing mikroRNA edytowanie RNA

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Michał Szcześniak 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: SONATA 8 - ogłoszony 2014-09-15

Przyznana kwota: 411 500 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-07-21

Zakończenie projektu: 2019-07-20

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Monitor. Za kwotę 1 407 PLN
  2. trzy komputery osobiste (3 szt.). Za kwotę 15 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. CANTATAdb: a Collection of Plant Long Non-coding RNAs IF: 4,77
    Autorzy:
    Szcześniak MW, Rosikiewicz W, Makałowska I
    Czasopismo:
    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY (rok: 2016, tom: 57(1), strony: 57(1):e8), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/pcp/pcv201 - link do publikacji
  2. KTCNlncDB-a first platform to investigate lncRNAs expressed in human keratoconus and non-keratoconus corneas IF: 3,29
    Autorzy:
    Szcześniak MW, Kabza M, Karolak JA, Rydzanicz M, Nowak DM, Ginter-Matuszewska B, Polakowski P, Ploski R, Szaflik JP, Gajecka M
    Czasopismo:
    Database-The Journal of Biological Databases and Curation (rok: 2017, tom: N/A, strony: 44567), Wydawca: OXFORD UNIV PRESS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/database/baw168 - link do publikacji
  3. Natural antisense transcripts in diseases: From modes of action to targeted therapies IF: 5,844
    Autorzy:
    Wanowska E, Kubiak MR, Rosikiewicz W, Makałowska I, Szcześniak MW
    Czasopismo:
    Wiley Interdiscip Rev RNA (rok: 2018, tom: 9, strony: Brak), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/wrna.1461 - link do publikacji
  4. Retroposition as a source of antisense long non-coding RNAs with possible regulatory functions IF: 0,77
    Autorzy:
    Oleksii Bryzghalov, Michał Wojciech Szcześniak, Izabela Makałowska
    Czasopismo:
    Acta Biochimica Polonica (rok: 2016, tom: 63, strony: 825-833), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne i Komitet Biochemii i Biofizyki PAN
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18388/abp.2016_1354 - link do publikacji
  5. SyntDB - defining orthologues of human long noncoding RNAs across primates IF: 11,15
    Autorzy:
    Bryzghalov, Oleksii; Szczesniak, Michal; Makalowska, Izabela
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2019, tom: 48, strony: D238–D245), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkz941 - link do publikacji
  6. lncRNA-RNA Interactions across the Human Transcriptome IF: 3,54
    Autorzy:
    Szcześniak MW, Makałowska I
    Czasopismo:
    PLoS One (rok: 2016, tom: 11(3), strony: 11(3):e0150353), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0150353 - link do publikacji
  7. A chromatin-associated splicing isoform of OIP5-AS1 acts in cis to regulate the OIP5 oncogene IF: 5,35
    Autorzy:
    Wanowska E, Kubiak M, Makałowska I, Szcześniak MW
    Czasopismo:
    RNA Biology (rok: 2021, tom: NA, strony: NA), Wydawca: Taylor & Francis
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/15476286.2021.1871816 - link do publikacji
  8. Towards a deeper annotation of human lncRNAs IF: 4,6
    Autorzy:
    Szcześniak MW, Wanowska E, Mukherjee N, Ohler U, Makałowska I
    Czasopismo:
    Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech (rok: 2019, tom: NA, strony: S1874-9399(18)30525-X), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagrm.2019.05.003 - link do publikacji
  9. lncEvo: automated identification and conservation study of long noncoding RNAs IF: 3,42
    Autorzy:
    Bryzghalov, O., Makałowska, I. & Szcześniak, M.W.
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2021, tom: 22, strony: NA), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12859-021-03991-2 - link do publikacji
  1. CANTATAdb 2.0: Expanding the Collection of Plant Long Noncoding RNAs
    Autorzy:
    Szcześniak MW, Bryzghalov O, Ciomborowska-Basheer J, Makałowska I
    Książka:
    Methods Mol Biol. (rok: 2019, tom: 1933, strony: 415-429), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana