Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Sekwencjonowanie nowej generacji transkryptomu miRNA i badania funkcjonalne in vitro w celu poznania patomechanizmow i heterogenności dziecięcej ostrej białaczki limfoblastycznej z limfocytów T (T-ALL)

2014/15/B/NZ2/03394

Słowa kluczowe:

ostra białaczka limfoblastyczna typu T sekwencjonowanie nowej generacji miRNA badania funkcjonalne in vitro - inhibicja/mimikra miRNA bioinformatyczna predykcja i modulacja in vitro docelowych mRNA

Deskryptory:

  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ5_3: Patogeneza chorób człowieka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Genetyki Człowieka PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Michał Witt 

Liczba wykonawców projektu: 11

Konkurs: OPUS 8 - ogłoszony 2014-09-15

Przyznana kwota: 1 395 010 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-08-01

Zakończenie projektu: 2021-02-04

Planowany czas trwania projektu: 66 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Inkubator.
  2. Laptop z oprogramowaniem. Za kwotę 7 000 PLN
  3. Lodowka. Za kwotę 2 000 PLN
  4. Wirówka.
  5. Cycler. Za kwotę 40 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. CRISPRi for specific inhibition of miRNA clusters and miRNAs with high sequence homology
    Autorzy:
    Monika Drobna-Śledzińska, Natalia Maćkowska-Maślak, Roman Jaksik, Paulina Dąbek, Michał Witt & Małgorzata Dawidowska
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12(1), strony: 6297 (nr artykułu)), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-022-10336-3. - link do publikacji
  2. Comprehensive investigation of miRNome identifies novel candidate miRNA-mRNA interactions implicated in T-cell acute lymphoblastic leukemia
    Autorzy:
    Dawidowska M, Jaksik R, Drobna M, Szarzyńska-Zawadzka B, Kosmalska M, Sędek Ł, Machowska L, Lalik A, Lejman M, Ussowicz M, Kałwak K, Kowalczyk JR, Szczepański T, Witt M.
    Czasopismo:
    Neoplasia (rok: 2019, tom: 21, strony: 294-310), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.neo.2019.01.004 - link do publikacji
  3. Translocation t(8;14)(q24;q11) with concurrent PTEN alterations and deletions of STIL/TAL1 and CDKN2A/B in a pediatric case of acute T-lymphoblastic leukemia: A genetic profile associated with adverse prognosis
    Autorzy:
    Skalska-Sadowska J, Dawidowska M, Szarzyńska-Zawadzka B, Jarmuż-Szymczak M, Czerwińska-Rybak J, Machowska L, Derwich K.
    Czasopismo:
    Pediatr Blood Cancer (rok: 2017, tom: 64(4), strony: e26266), Wydawca: Wiley Periodicals, Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/pbc.26266 - link do publikacji
  4. DNA Methylation in T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia: In Search for Clinical and Biological Meaning
    Autorzy:
    Maćkowska M, Drobna-Śledzińska M, Witt M, Dawidowska M
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22, strony: brak (tylko online)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22031388 - link do publikacji
  5. RNA-seq library preparation for comprehensive transcriptome analysis in cancer cells: The impact of insert size
    Autorzy:
    Roman Jaksik, Monika Drobna-Śledzińska, Małgorzata Dawidowska
    Czasopismo:
    Genomics (rok: 2021, tom: 113, strony: 4149-4162), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.018 - link do publikacji
  6. T-cell acute lymphoblastic leukemia from miRNA perspective: basic concepts, experimental approaches, and potential biomarkers
    Autorzy:
    Monika Drobna, Bronisława Szarzyńska-Zawadzka, Małgorzata Dawidowska
    Czasopismo:
    Blood Reviews (rok: 2018, tom: 32, strony: 457-472), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.blre.2018.04.003 - link do publikacji
  7. hsa-miR-20b-5p and hsa-miR-363-3p Affect Expression of PTEN and BIM Tumor Suppressor Genes and Modulate Survival of T-ALL Cells In Vitro
    Autorzy:
    Drobna M, Szarzyńska B, Jaksik R, Sędek Ł, Kuchmiy A, Taghon T, Van Vlierberghe P, Szczepański T, Witt M, Dawidowska M
    Czasopismo:
    Cells (rok: 2020, tom: 9, strony: brak (tylko online)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cells9051137 - link do publikacji
  8. Identification of Endogenous Control miRNAs for RT-qPCR in T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia
    Autorzy:
    Drobna M, Szarzyńska-Zawadzka B, Daca-Roszak P, Kosmalska M, Jaksik R, Witt M, Dawidowska M.
    Czasopismo:
    Int J Mol Sci (rok: 2018, tom: 19, strony: 45308), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms19102858 - link do publikacji
  9. Small RNA-Seq Reveals Similar miRNA Transcriptome in Children and Young Adults with T-ALL and Indicates miR-143-3p as Novel Candidate Tumor Suppressor in This Leukemia.
    Autorzy:
    Dawidowska M, Maćkowska-Maślak N, Drobna-Śledzińska M, Kosmalska M, Jaksik R, Szymczak D, Jarmuż-Szymczak M, Sadowska-Klasa A, Wojtaszewska M, Sędek Ł, Wróbel T, Zaucha JM, Szczepański T, Lewandowski K, Giebel S, Witt M.
    Czasopismo:
    Int J Mol Sci. (rok: 2022, tom: 23(17), strony: 10117 (nr artykułu)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms231710117 - link do publikacji
  10. Multiomics to investigate the mechanisms contributing to repression of PTPRC and SOCS2 in pediatric T-ALL: Focus on miR-363-3p and promoter methylation
    Autorzy:
    Drobna-Śledzińska M, Maćkowska-Maślak N, Jaksik R, Kosmalska M, Szarzyńska B, Lejman M, Sędek Ł, Szczepański T, Taghon T, Van Vlierberghe P, Witt M, Dawidowska M.
    Czasopismo:
    Genes Chromosomes Cancer (rok: 2022, tom: 61(12), strony: 720-733), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/gcc.23085 - link do publikacji
  1. Molecular biology of leukaemia
    Autorzy:
    Małgorzata Dawidowska, Michał Witt
    Książka:
    Leukaemia & Myeloma: Essentials for Clinicians (rok: 2019, tom: nie dotyczy, strony: 63-66), Wydawca: ESMO Press
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy