Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Poszukiwanie mechanizmów indukujących polimorfizm liczby kopii dużych fragmentów genomu oraz związków tego zjawiska z tworzeniem i ewolucją metabolicznych klastrów genów

2014/13/B/NZ2/03837

Słowa kluczowe:

CNV zmienność liczby kopii ko-ekspresja metaboliczny klaster genów

Deskryptory:

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ8_9: Genetyka populacyjna
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Marek Figlerowicz 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 7 - ogłoszony 2014-03-17

Przyznana kwota: 911 900 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-02-01

Zakończenie projektu: 2019-07-25

Planowany czas trwania projektu: 53 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Komputer stacjonarny z monitorem LCD. Za kwotę 11 000 PLN
  2. Oprogramowanie GeneMarker do analizy wyników MLPA.
  3. Monitor. Za kwotę 1 382 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  1. Arabidopsis thaliana population analysis reveals high plasticity of the genomic region spanning MSH2, AT3G18530 and AT3G18535 genes and provides evidence for NAHR-driven recurrent CNV events occurring in this location
    Autorzy:
    Agnieszka Zmienko, Anna Samelak-Czajka, Piotr Kozlowski, Maja Szymanska, Marek Figlerowicz
    Czasopismo:
    BMC Genomics (rok: 2016, tom: 17, strony: 893), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12864-016-3221-1 - link do publikacji
  2. AthCNV: A Map of DNA Copy Number Variations in the Arabidopsis thaliana Genome
    Autorzy:
    Agnieszka Żmieńko, Małgorzata Marszałek-Zeńczak, Paweł Wojciechowski, Anna Samelak-Czajka, Magdalena Łuczak, Piotr Kozłowski, Wojciech M. Karłowski, Marek Figlerowicz
    Czasopismo:
    Plant Cell (rok: 2020, tom: 32, strony: 45314), Wydawca: AMER SOC PLANT BIOLOGISTS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1105/tpc.19.00640 - link do publikacji
  3. Analysis of Arabidopsis non-reference accessions reveals high diversity of metabolic gene clusters and discovers new candidate cluster members
    Autorzy:
    Malgorzata Marszalek-Zenczak, Anastasiia Satyr, Pawel Wojciechowski, Michal Zenczak, Paula Sobieszczanska, Krzysztof Brzezinski, Tetiana Iefimenko, Marek Figlerowicz, Agnieszka Zmienko
    Czasopismo:
    Frontiers in Plant Science (rok: 2023, tom: 14, strony: nie dotyczy), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fpls.2023.1104303 - link do publikacji
  4. MLPA-based Analysis of Copy Number Variation in Plant Populations
    Autorzy:
    Anna Samelak-Czajka, Malgorzata Marszalek-Zenczak, Malgorzata Marcinkowska-Swojak, Piotr Kozlowski, Marek Figlerowicz, Agnieszka Zmienko
    Czasopismo:
    Frontiers in Plant Science (rok: 2017, tom: 8, strony: nie dotyczy), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fpls.2017.00222 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy