Wieloparametrowe obrazowanie komórek przy pomocy spektroskopii oscylacyjnej, AFM i SNOM: analiza biochemicznych zmian w pojedynczych komórkach śródbłonka wywołanych stresem, patologią i terapią lekową
2013/08/A/ST4/00308
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST5_16: Chemia biologiczna
- ST4_3: Metody spektroskopowe i spektrometryczne
- ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
Panel
ST4 – Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Jagielloński, Wydział Chemii
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 9
Konkurs
MAESTRO 4 – ogłoszony 2012-12-15
- Przyznana kwota
- 2 224 400 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2013-09-17
- Zakończenie projektu
- 2017-09-16
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- 3 komputery stacjonarne (3 szt.). Za kwotę 7 500 PLN
- 3 laptopy (3 szt.). Za kwotę 10 388 PLN
- Elementy optyki do detektora FPA. Za kwotę 20 970 PLN
- Lasery (2 szt.). Za kwotę 140 000 PLN
- Mieszadło mechaniczne. Za kwotę 5 000 PLN
- Miniwytrząsarka typu Vertex. Za kwotę 1 500 PLN
- Objektyw imersyjny. Za kwotę 20 000 PLN
- Oprogramowanie chemometryczne i spektroskopowe, np. WitecPlus, The Unscrambler, Neurodeveloper, Origin (2 szt.). Za kwotę 13 000 PLN
- Program do pomiarów i analizy danych AFM w trybie PFM i/lub DPFM. Za kwotę 90 000 PLN
- Przystawka pomiarowa do spektrometru.
- Ramanowski spektrometr dyspersyjny ze wzbudzeniem w zakresie widzialnym/NIR (1 laser). Za kwotę 10 436 PLN
- System oczyszczania wody Millipore z lampą UV. Za kwotę 12 000 PLN
- Urządzenie wielofunkcyjne. Za kwotę 1 968 PLN
- Wirówka mikrolitrowa z przyspieszeniem do 18 000 obrótów i regulacją temperatury. Za kwotę 6 000 PLN
- elementy optyczne, elektroniczne i mechaniczne do spektrometrów. Za kwotę 24 000 PLN
- komputer stacjonarny z 2 monitorami o wysokiej mocy obliczeniowej. Za kwotę 5 000 PLN
- licencja oprogramowania office.
- pH-metr.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (24)
-
Raman microspectroscopy of human aortic valves: investigation of the local and global biochemical changes associated with calcification in aortic stenosis
- Autorzy:
- Krzysztof Czamara, Joanna Natorska, Przemysław Kapusta, Malgorzata Baranska and Agnieszka Kaczor
- Czasopismo:
- Analyst (rok: 2015, tom: 46, strony: 46132), Wydawca: RSC
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/C4AN01856G – link do publikacji
-
Nuclear accumulation of anthracyclines in the endothelium studied by bimodal imaging: fluorescence and Raman microscopy
- Autorzy:
- K. Majzner, T. Wojcik, E. Szafraniec, M. Lukawska, I. Oszczapowicz, S. Chlopicki and M. Baranska
- Czasopismo:
- Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 2302-2310), Wydawca: RSC
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/C4AN01882F – link do publikacji
-
Vascular diseases investigated ex vivo by using Raman, FT-IR and other methods
- Autorzy:
- K.M. Marzec, A. Rygula, M. Gasior-Glogowska, K. Kochan, K. Czamara, K. Bulat, K. Malek, A. Kaczor, M. Baranska
- Czasopismo:
- Pharmacological Reports (rok: 2015, tom: 67, strony: 744-750), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.pharep.2015.05.001 – link do publikacji
-
Identification of a biochemical marker for endothelial dysfunction using Raman spectroscopy
- Autorzy:
- A. Rygula, M. Z. Pacia, L. Mateuszuk, A. Kaczor, R. B. Kostogrys, S. Chlopicki and M. Baranska
- Czasopismo:
- Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 2185-2189), Wydawca: RSC
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/C4AN01998A – link do publikacji
-
Complementary analysis of tissue homogenates composition obtained by Vis and NIR laser excitations and Raman spectroscopy
- Autorzy:
- E. Staniszewska-Slezak, K. Malek, M. Baranska
- Czasopismo:
- Spectrochimica Acta A (rok: 2015, tom: 147, strony: 245-256), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.saa.2015.03.086 – link do publikacji
-
Resonance Raman in Vitro Detection and Differentiation of the Nitrite-Induced Hemoglobin Adducts in Functional Human Red Blood Cells
- Autorzy:
- K. M. Marzec, J. Dybas, S. Chlopicki, M. Baranska
- Czasopismo:
- The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2016, tom: 120, strony: 12249-12260), Wydawca: ACS Publications
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/acs.jpcb.6b08359 – link do publikacji
-
Spectroscopic studies of anthracyclines: Structural characterization and in vitro tracking
- Autorzy:
- E. Szafraniec, K. Majzner, Z. Farhane, H. J. Byrne, M. Lukawska, I. Oszczapowicz, S. Chlopicki, Malgorzata Baranska
- Czasopismo:
- Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (rok: 2016, tom: 169, strony: 152-160), Wydawca: ELSEVIER
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.saa.2016.06.035 – link do publikacji
-
Live endothelial cells imaged by Scanning Near-field Optical Microscopy (SNOM): capabilities and challenges
- Autorzy:
- K. Bulat, A. Rygula, E. Szafraniec, Y. Ozaki, M. Baranska
- Czasopismo:
- Journal of Biophotonics (rok: 2078, tom: 10, strony: 928-937), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/jbio.201600081 – link do publikacji
-
Unsaturated lipid bodies as a hallmark of inflammation studied by Raman 2D and 3D microscopy
- Autorzy:
- K. Czamara, K. Majzner, A. Selmi, M. Baranska, Y. Ozaki, A. Kaczor
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: 46032), Wydawca: Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/srep40889 – link do publikacji
-
Raman spectroscopy as a sensitive probe of soft tissue composition – Imaging of cross-sections of various organs vs. single spectra of tissue homogenates
- Autorzy:
- J. Dybas, K. M. Marzec, M. Z. Pacia, K. Kochan, K. Czamara, K. Chrabaszcz, E. Staniszewska-Slezak, K. Malek, M. Baranska, A. Kaczor
- Czasopismo:
- Trends in Analytical Chemistry (rok: 2016, tom: 85, strony: 117-127), Wydawca: ELSEVIER
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.trac.2016.08.014 – link do publikacji
-
A new insight into the interaction of cisplatin with DNA: ROA spectroscopic studies on the therapeutic effect of the drug
- Autorzy:
- M. Gąsior-Głogowska, K. Malek ,G. Zajac, M. Baranska
- Czasopismo:
- Analyst (rok: 2016, tom: 141, strony: 291-296), Wydawca: Royal Society of Chemistry
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/C5AN02140E – link do publikacji
-
A possible Fourier transform infrared-based plasma fingerprint of angiotensin-converting enzyme inhibitor-induced reversal of endothelial dysfunction in diabetic mice
- Autorzy:
- E.Staniszewska-Slezak, E. Wiercigroch, A. Fedorowicz, E. Buczek, L.Mateuszuk, M. Baranska, S. Chlopicki, K. Malek
- Czasopismo:
- J. Biophotonics (rok: 2017, tom: e201700044., strony: 46033), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/jbio.201700044 – link do publikacji
-
3D Raman imaging of systemic endothelial dysfunction in the murine model of metastatic breast cancer
- Autorzy:
- M. Z. Pacia, E. Buczek, A. Blazejczyk, A. Gregorius, J. Wietrzyk, S. Chlopicki, M. Baranska, A. Kaczor
- Czasopismo:
- Anal. Bioanal. Chem. (rok: 2016, tom: 408, strony: 3381–3387), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00216-016-9436-9 – link do publikacji
-
Raman microscopy as a novel tool to detect endothelial dysfunction
- Autorzy:
- M. Baranska, A. Kaczor, K. Malek, A. Jaworska, K. Majzner, E. Staniszewska-Slezak, M.Z. Pacia, G. Zajac, J. Dybas, E. Wiercigroch
- Czasopismo:
- Pharmacological Reports (rok: 2015, tom: 67, strony: 736-743), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.pharep.2015.03.015 – link do publikacji
-
Raman microscopy at the subcellular level: study on early apoptosis in endothelial cells induced by Fas ligand and cycloheximide
- Autorzy:
- K.Czamara, F. Petko, M. Baranska, A. Kaczor
- Czasopismo:
- Analyst (rok: 2016, tom: 141, strony: 1390-1397), Wydawca: Royal Society of Chemistry
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/C5AN02202A – link do publikacji
-
A novel approach to investigate vascular wall in 3D: Combined Raman spectroscopy and atomic force microscopy for aorta en face imaging
- Autorzy:
- Marta Pilarczyk, b, Anna Rygula, Agnieszka Kaczora, Lukasz Mateuszuk, Edyta Maślak, Stefan Chlopicki, Małgorzata Barańska
- Czasopismo:
- Vibrational Spectroscopy (rok: 2014, tom: 75, strony: 39-44), Wydawca: ELSEVIER
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.vibspec.2014.09.004 – link do publikacji
-
Rhodamine 6G conjugated to gold nanoparticles as labels for both SERS and fluorescence studies on live endothelial cells
- Autorzy:
- Aleksandra Jaworska & Tomasz Wojcik & Kamilla Malek & Urszula Kwolek & Mariusz Kepczynski & Abu A. Ansary & Stefan Chlopicki & Malgorzata Baranska
- Czasopismo:
- Microchim Acta (rok: 2015, tom: 182, strony: 119-127), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00604-014-1307-5 – link do publikacji
-
Raman imaging providing insights into chemical composition of lipid droplets of different size and orgin: in hepatocytes and endothelium
- Autorzy:
- Katarzyna Majzner , Kamila Kochan , Neli Kachamakova-Trojanowska , Edyta Maslak , Stefan Chlopicki , Malgorzata Baranska
- Czasopismo:
- Analyticall chemistry (rok: 2014, tom: 86, strony: 6666-6674), Wydawca: ACS
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/ac501395g – link do publikacji
-
Impact of cell cycle dynamics on pathology recognition: Raman imaging study
- Autorzy:
- K. Czamara, E. Karnas, Z. Majka, T. Wojcik, E. Zuba-Surma, M. Baranska, A. Kaczor
- Czasopismo:
- Journal of Biophotonics (rok: 2018, tom: e201800152, strony: 46032), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/jbio.201800152 – link do publikacji
-
Raman Optical Activity and Raman spectroscopy of carbohydrates in solution
- Autorzy:
- M. Dudek, G. Zajac, E. Szafraniec, E. Wiercigroch, S. Tott, K. Malek, A. Kaczor, M. Baranska
- Czasopismo:
- Spectrochimica Acta A (rok: 2019, tom: 206, strony: 597-612), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.saa.2018.08.017 – link do publikacji
-
Raman spectroscopy of lipids: a review
- Autorzy:
- K. Czamara, K. Majzner, M. Z. Pacia, K. Kochan, A. Kaczor, M. Baranska
- Czasopismo:
- Journal of Raman Spectroscopy (rok: 2015, tom: 46, strony: 46132), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/jrs.4607 – link do publikacji
-
Transmission versus transflection mode in FTIR analysis of blood plasma: is the electric field standing wave effect the only reason for observed spectral distortions?
- Autorzy:
- Staniszewska-Slezak , Rygula A, Malek K, Baranska M
- Czasopismo:
- Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 2412-2421), Wydawca: RSC
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/C4AN01842G – link do publikacji
-
Polypyridyl Substituted BODIPY Derivatives; Water Switchable Probes for Imaging Non-Aqueous Domains in Cells that Exhibit Halogen Substituent Dependent Localisation
- Autorzy:
- C. Dolan, A. Byrne, C. Long, K. Czamara, A. Kaczor, M. Baranska, T.E. Keyes
- Czasopismo:
- RSC Advances (rok: 2017, tom: 7, strony: 43743–43754), Wydawca: RSC
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/c7ra07493j – link do publikacji
-
Biochemical changes of the endothelium in the murine model of NO-deficient hypertension
- Autorzy:
- M. Z. Pacia , L. Mateuszukb, S. Chlopicki , M. Baranska , A. Kaczor
- Czasopismo:
- Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 2178-2184), Wydawca: RCS
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/C4AN01870B – link do publikacji