Wieloparametrowe obrazowanie komórek przy pomocy spektroskopii oscylacyjnej, AFM i SNOM: analiza biochemicznych zmian w pojedynczych komórkach śródbłonka wywołanych stresem, patologią i terapią lekową

2013/08/A/ST4/00308

Słowa kluczowe

Deskryptory

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST4_3: Metody spektroskopowe i spektrometryczne
  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych

Panel

ST4 – Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Chemii

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki »

Kierownik projektu (z jednostki realizującej)

prof. Małgorzata Barańska

Liczba wykonawców projektu: 9

Konkurs

MAESTRO 4 – ogłoszony 2012-12-15

Przyznana kwota
2 224 400 PLN
Rozpoczęcie projektu
2013-09-17
Zakończenie projektu
2017-09-16
Planowany czas trwania projektu
48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu
Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. 3 komputery stacjonarne (3 szt.). Za kwotę 7 500 PLN
  2. 3 laptopy (3 szt.). Za kwotę 10 388 PLN
  3. Elementy optyki do detektora FPA. Za kwotę 20 970 PLN
  4. Lasery (2 szt.). Za kwotę 140 000 PLN
  5. Mieszadło mechaniczne. Za kwotę 5 000 PLN
  6. Miniwytrząsarka typu Vertex. Za kwotę 1 500 PLN
  7. Objektyw imersyjny. Za kwotę 20 000 PLN
  8. Oprogramowanie chemometryczne i spektroskopowe, np. WitecPlus, The Unscrambler, Neurodeveloper, Origin (2 szt.). Za kwotę 13 000 PLN
  9. Program do pomiarów i analizy danych AFM w trybie PFM i/lub DPFM. Za kwotę 90 000 PLN
  10. Przystawka pomiarowa do spektrometru.
  11. Ramanowski spektrometr dyspersyjny ze wzbudzeniem w zakresie widzialnym/NIR (1 laser). Za kwotę 10 436 PLN
  12. System oczyszczania wody Millipore z lampą UV. Za kwotę 12 000 PLN
  13. Urządzenie wielofunkcyjne. Za kwotę 1 968 PLN
  14. Wirówka mikrolitrowa z przyspieszeniem do 18 000 obrótów i regulacją temperatury. Za kwotę 6 000 PLN
  15. elementy optyczne, elektroniczne i mechaniczne do spektrometrów. Za kwotę 24 000 PLN
  16. komputer stacjonarny z 2 monitorami o wysokiej mocy obliczeniowej. Za kwotę 5 000 PLN
  17. licencja oprogramowania office.
  18. pH-metr.

Dane z raportu końcowego/rocznego

Publikacje w czasopismach (24)

  1. Raman microspectroscopy of human aortic valves: investigation of the local and global biochemical changes associated with calcification in aortic stenosis

    Autorzy:
    Krzysztof Czamara, Joanna Natorska, Przemysław Kapusta, Malgorzata Baranska and Agnieszka Kaczor
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2015, tom: 46, strony: 46132), Wydawca: RSC
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/C4AN01856G – link do publikacji
  2. Nuclear accumulation of anthracyclines in the endothelium studied by bimodal imaging: fluorescence and Raman microscopy

    Autorzy:
    K. Majzner, T. Wojcik, E. Szafraniec, M. Lukawska, I. Oszczapowicz, S. Chlopicki and M. Baranska
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 2302-2310), Wydawca: RSC
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/C4AN01882F – link do publikacji
  3. Vascular diseases investigated ex vivo by using Raman, FT-IR and other methods

    Autorzy:
    K.M. Marzec, A. Rygula, M. Gasior-Glogowska, K. Kochan, K. Czamara, K. Bulat, K. Malek, A. Kaczor, M. Baranska
    Czasopismo:
    Pharmacological Reports (rok: 2015, tom: 67, strony: 744-750), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.pharep.2015.05.001 – link do publikacji
  4. Identification of a biochemical marker for endothelial dysfunction using Raman spectroscopy

    Autorzy:
    A. Rygula, M. Z. Pacia, L. Mateuszuk, A. Kaczor, R. B. Kostogrys, S. Chlopicki and M. Baranska
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 2185-2189), Wydawca: RSC
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/C4AN01998A – link do publikacji
  5. Complementary analysis of tissue homogenates composition obtained by Vis and NIR laser excitations and Raman spectroscopy

    Autorzy:
    E. Staniszewska-Slezak, K. Malek, M. Baranska
    Czasopismo:
    Spectrochimica Acta A (rok: 2015, tom: 147, strony: 245-256), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.saa.2015.03.086 – link do publikacji
  6. Resonance Raman in Vitro Detection and Differentiation of the Nitrite-Induced Hemoglobin Adducts in Functional Human Red Blood Cells

    Autorzy:
    K. M. Marzec, J. Dybas, S. Chlopicki, M. Baranska
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2016, tom: 120, strony: 12249-12260), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1021/acs.jpcb.6b08359 – link do publikacji
  7. Spectroscopic studies of anthracyclines: Structural characterization and in vitro tracking

    Autorzy:
    E. Szafraniec, K. Majzner, Z. Farhane, H. J. Byrne, M. Lukawska, I. Oszczapowicz, S. Chlopicki, Malgorzata Baranska
    Czasopismo:
    Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (rok: 2016, tom: 169, strony: 152-160), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.saa.2016.06.035 – link do publikacji
  8. Live endothelial cells imaged by Scanning Near-field Optical Microscopy (SNOM): capabilities and challenges

    Autorzy:
    K. Bulat, A. Rygula, E. Szafraniec, Y. Ozaki, M. Baranska
    Czasopismo:
    Journal of Biophotonics (rok: 2078, tom: 10, strony: 928-937), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1002/jbio.201600081 – link do publikacji
  9. Unsaturated lipid bodies as a hallmark of inflammation studied by Raman 2D and 3D microscopy

    Autorzy:
    K. Czamara, K. Majzner, A. Selmi, M. Baranska, Y. Ozaki, A. Kaczor
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: 46032), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1038/srep40889 – link do publikacji
  10. Raman spectroscopy as a sensitive probe of soft tissue composition – Imaging of cross-sections of various organs vs. single spectra of tissue homogenates

    Autorzy:
    J. Dybas, K. M. Marzec, M. Z. Pacia, K. Kochan, K. Czamara, K. Chrabaszcz, E. Staniszewska-Slezak, K. Malek, M. Baranska, A. Kaczor
    Czasopismo:
    Trends in Analytical Chemistry (rok: 2016, tom: 85, strony: 117-127), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.trac.2016.08.014 – link do publikacji
  11. A new insight into the interaction of cisplatin with DNA: ROA spectroscopic studies on the therapeutic effect of the drug

    Autorzy:
    M. Gąsior-Głogowska, K. Malek ,G. Zajac, M. Baranska
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2016, tom: 141, strony: 291-296), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/C5AN02140E – link do publikacji
  12. A possible Fourier transform infrared-based plasma fingerprint of angiotensin-converting enzyme inhibitor-induced reversal of endothelial dysfunction in diabetic mice

    Autorzy:
    E.Staniszewska-Slezak, E. Wiercigroch, A. Fedorowicz, E. Buczek, L.Mateuszuk, M. Baranska, S. Chlopicki, K. Malek
    Czasopismo:
    J. Biophotonics (rok: 2017, tom: e201700044., strony: 46033), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1002/jbio.201700044 – link do publikacji
  13. 3D Raman imaging of systemic endothelial dysfunction in the murine model of metastatic breast cancer

    Autorzy:
    M. Z. Pacia, E. Buczek, A. Blazejczyk, A. Gregorius, J. Wietrzyk, S. Chlopicki, M. Baranska, A. Kaczor
    Czasopismo:
    Anal. Bioanal. Chem. (rok: 2016, tom: 408, strony: 3381–3387), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1007/s00216-016-9436-9 – link do publikacji
  14. Raman microscopy as a novel tool to detect endothelial dysfunction

    Autorzy:
    M. Baranska, A. Kaczor, K. Malek, A. Jaworska, K. Majzner, E. Staniszewska-Slezak, M.Z. Pacia, G. Zajac, J. Dybas, E. Wiercigroch
    Czasopismo:
    Pharmacological Reports (rok: 2015, tom: 67, strony: 736-743), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.pharep.2015.03.015 – link do publikacji
  15. Raman microscopy at the subcellular level: study on early apoptosis in endothelial cells induced by Fas ligand and cycloheximide

    Autorzy:
    K.Czamara, F. Petko, M. Baranska, A. Kaczor
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2016, tom: 141, strony: 1390-1397), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/C5AN02202A – link do publikacji
  16. A novel approach to investigate vascular wall in 3D: Combined Raman spectroscopy and atomic force microscopy for aorta en face imaging

    Autorzy:
    Marta Pilarczyk, b, Anna Rygula, Agnieszka Kaczora, Lukasz Mateuszuk, Edyta Maślak, Stefan Chlopicki, Małgorzata Barańska
    Czasopismo:
    Vibrational Spectroscopy (rok: 2014, tom: 75, strony: 39-44), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.vibspec.2014.09.004 – link do publikacji
  17. Rhodamine 6G conjugated to gold nanoparticles as labels for both SERS and fluorescence studies on live endothelial cells

    Autorzy:
    Aleksandra Jaworska & Tomasz Wojcik & Kamilla Malek & Urszula Kwolek & Mariusz Kepczynski & Abu A. Ansary & Stefan Chlopicki & Malgorzata Baranska
    Czasopismo:
    Microchim Acta (rok: 2015, tom: 182, strony: 119-127), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1007/s00604-014-1307-5 – link do publikacji
  18. Raman imaging providing insights into chemical composition of lipid droplets of different size and orgin: in hepatocytes and endothelium

    Autorzy:
    Katarzyna Majzner , Kamila Kochan , Neli Kachamakova-Trojanowska , Edyta Maslak , Stefan Chlopicki , Malgorzata Baranska
    Czasopismo:
    Analyticall chemistry (rok: 2014, tom: 86, strony: 6666-6674), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1021/ac501395g – link do publikacji
  19. Impact of cell cycle dynamics on pathology recognition: Raman imaging study

    Autorzy:
    K. Czamara, E. Karnas, Z. Majka, T. Wojcik, E. Zuba-Surma, M. Baranska, A. Kaczor
    Czasopismo:
    Journal of Biophotonics (rok: 2018, tom: e201800152, strony: 46032), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1002/jbio.201800152 – link do publikacji
  20. Raman Optical Activity and Raman spectroscopy of carbohydrates in solution

    Autorzy:
    M. Dudek, G. Zajac, E. Szafraniec, E. Wiercigroch, S. Tott, K. Malek, A. Kaczor, M. Baranska
    Czasopismo:
    Spectrochimica Acta A (rok: 2019, tom: 206, strony: 597-612), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.saa.2018.08.017 – link do publikacji
  21. Raman spectroscopy of lipids: a review

    Autorzy:
    K. Czamara, K. Majzner, M. Z. Pacia, K. Kochan, A. Kaczor, M. Baranska
    Czasopismo:
    Journal of Raman Spectroscopy (rok: 2015, tom: 46, strony: 46132), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1002/jrs.4607 – link do publikacji
  22. Transmission versus transflection mode in FTIR analysis of blood plasma: is the electric field standing wave effect the only reason for observed spectral distortions?

    Autorzy:
    Staniszewska-Slezak , Rygula A, Malek K, Baranska M
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 2412-2421), Wydawca: RSC
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/C4AN01842G – link do publikacji
  23. Polypyridyl Substituted BODIPY Derivatives; Water Switchable Probes for Imaging Non-Aqueous Domains in Cells that Exhibit Halogen Substituent Dependent Localisation

    Autorzy:
    C. Dolan, A. Byrne, C. Long, K. Czamara, A. Kaczor, M. Baranska, T.E. Keyes
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2017, tom: 7, strony: 43743–43754), Wydawca: RSC
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/c7ra07493j – link do publikacji
  24. Biochemical changes of the endothelium in the murine model of NO-deficient hypertension

    Autorzy:
    M. Z. Pacia , L. Mateuszukb, S. Chlopicki , M. Baranska , A. Kaczor
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2015, tom: 140, strony: 2178-2184), Wydawca: RCS
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1039/C4AN01870B – link do publikacji

« Nowe wyszukiwanie

Projekt graficzny i wykonanie: Jakub Piotrowski