Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Modelowanie aktywności transpozonów indukowanej stresem

2012/06/M/ST6/00438

Słowa kluczowe:

transpozon stres środowiskowy proliferacja model stochastyczny

Deskryptory:

  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji
  • ST6_11: Uczenie maszynowe, statystyczne przetwarzanie danych i zastosowanie w przetwarzaniu sygnałów

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Anna Barbara Gambin 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: HARMONIA 3 - ogłoszony 2012-06-15

Przyznana kwota: 396 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-03-27

Zakończenie projektu: 2016-09-26

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Genomic parasites or symbionts? Modeling the effects of environmental pressure on transposition activity in asexual populations.
    Autorzy:
    Startek M, Le Rouzic A, Capy P, Grzebelus D, Gambin A.
    Czasopismo:
    Theoretical Population Biology (), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.tpb.2013.07.004 - link do publikacji
  2. MuTAnT: a family of Mutator-like transposable elements targeting TA microsatellites in Medicago truncatula.
    Autorzy:
    Stawujak K, Startek M, Gambin A, Grzebelus D
    Czasopismo:
    Genetica (rok: 2015, tom: 143(4), strony: 433-440), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10709-015-9842-5 - link do publikacji
  3. Genome-wide analyses of LINE-LINE-mediated nonallelic homologous recombination
    Autorzy:
    Startek M, Szafranski P, Gambin T, Campbell IM, Hixson P, Shaw CA, Stankiewicz P, Gambin A.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Res (rok: 2015, tom: 43(4), strony: 2188-98), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gku1394 - link do publikacji
  4. Inferring transposons activity chronology by TRANScendence: TEs database and de-novo mining tool
    Autorzy:
    M. Startek, J. Nogły, A. Gromadka, D. Grzebelus, A. Gambin
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (tom: 18 (suppl 12), strony: ), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12859-017-1824-4 - link do publikacji
  5. Genomic parasites or symbionts? Modeling the effects of environmental pressure on transposition activity in asexual populations.
    Autorzy:
    Startek M, Le Rouzic A, Capy P, Grzebelus D, Gambin A.
    Czasopismo:
    Theoretical Population Biology (rok: 2013, tom: 90, strony: 145-151), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.tpb.2013.07.004 - link do publikacji
  6. Leaf and Plant Age Affects Photosynthetic Performance and Photoprotective Capacity
    Autorzy:
    Ludwik W. Bielczynski, Mateusz K. Łącki, Iris Hoefnagels, Anna Gambin, Roberta Croce
    Czasopismo:
    Plant Physiology (rok: 2017, tom: 175(4), strony: 1634-1648), Wydawca: American Society of Plant Biologists
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1104/pp.17.00904 - link do publikacji
  7. Inferring transposons activity chronology by TRANScendence: TEs database and de-novo mining tool
    Autorzy:
    M. Startek, J. Nogły, A. Gromadka, D. Grzebelus, A. Gambin
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2017, tom: 18 (suppl 12), strony: 422), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12859-017-1824-4 - link do publikacji
  1. TRANScendence: transposable elements database and de-novo mining tool allows inferring TEs activity chronology
    Autorzy:
    Michał Startek, Jakub Nogł􏰀y, Dariusz Grzebelus, Anna Gambin
    Konferencja:
    The International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (rok: 2016, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja Jun 5, 2016 - Jun 8, 2016
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy