Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Wpływ sekwencji nukleotydowej na wydajność radio- i fotouszkodzeń dwuniciowych fragmentów DNA znakowanych halogenopochodnymi zasad nukleinowych

2012/05/B/ST5/00368

Słowa kluczowe:

radio- i fotouszkodzenia DNA aniony halogenopochodnych zasad nukleinowych dalekozasięgowy transfer elektronu DHPLC spektrometria mas ilościowy PCR

Deskryptory:

  • ST5_11: Synteza biomateriałów
  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_19: Metody badań właściwości materiałów

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Janusz Rak 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 3 - ogłoszony 2012-03-15

Przyznana kwota: 597 400 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-03-01

Zakończenie projektu: 2016-03-04

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Termocykler do real-time PCR-u wraz z oprogramowaniem do analizy temperatur topnienia (Biorad CFX96 plus program HRM – www.biorad.com wraz z oprogramowaniem Precision Melt Analysis Software). Za kwotę 175 000 PLN
  2. Modernizacja stanowiska do naświetlań UV. Za kwotę 46 999 PLN
  3. Wirówka (Spectrafuge Mini, Labnet International).
  4. Wysokosprawny chromatograf cieczowy firmy Shimadzu (używany).
  5. Zestaw do elektroforezy pozioomej (Bio-Rad Polska Sp. z o.o).

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Quantitative assay of photoinduced DNA strand breaks by real-time PCR
    Autorzy:
    Justyna Wiczk, Kinga Westphal, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis (rok: 2016, tom: 128, strony: 1480–484), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jpba.2016.06.023 - link do publikacji
  2. Reactivity Pattern of Bromonucleosides Induced by 2-Hydroxypropyl Radicals. Photo-, Radiation-chemical and Computational Studies
    Autorzy:
    Magdalena Zdrowowicz, Lidia Chomicz, Justyna Miloch, Justyna Wiczk, Janusz Rak, Gabriel Kciuk, Krzysztof Bobrowski
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2015, tom: 119, strony: 6545−6554), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.5b01904 - link do publikacji
  3. UV-Induced Strand Breaks in Double-Stranded DNA Labeled with 5-Bromouracil: Frank or Secondary?
    Autorzy:
    Justyna Wiczk, Justyna Miloch, Janusz Rak
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry Letters (rok: 2013, tom: 4, strony: 4014-4018), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/jz402208z - link do publikacji
  4. 5-Bromo-2'-deoxycytidine — a Potential DNA Photosensitizer
    Autorzy:
    Magdalena Zdrowowicz, Paweł Wityk, Barbara Michalska, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2016, tom: 14, strony: 9312-9321), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C6OB01446A - link do publikacji
  5. Irreversible electron attachment – a key to DNA damage by solvated electrons in aqueous solution
    Autorzy:
    Kinga Westphal, Justyna Wiczk, Justyna Miloch, Gabriel Kciuk, Krzysztof Bobrowski, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2015, tom: 13, strony: 10362–10369), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c5ob01542a - link do publikacji
  6. Mechanisms of Damage to DNA Labeled with Electrophilic Nucleobases Induced by Ionizing or UV Radiation
    Autorzy:
    Janusz Rak, Lidia Chomicz, Justyna Wiczk, Kinga Westphal, Magdalena Zdrowowicz, Paweł Wityk, Michał Żyndul, Samanta Makurat, Łukasz Golon
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2015, tom: 119, strony: 8227−8238), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.5b03948 - link do publikacji
  7. Chemically–enzymatic synthesis of photosensitive DNA
    Autorzy:
    Kinga Westphal, Magdalena Zdrowowicz, Agnieszka Zylicz-Stachula, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Journal of Photochemistry & Photobiology, B: Biology (rok: 2017, tom: 167, strony: 228–235), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jphotobiol.2017.01.005 - link do publikacji
  8. Radiation damage to single stranded oligonucleotide trimers labelled with 5-iodopyrimidines
    Autorzy:
    Kinga Westphal, Konrad Skotnicki, Krzysztof Bobrowski, Janusz Rak
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2016, tom: 14, strony: 9331-9337), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C6OB01713D - link do publikacji