Unikatowy system sekrecji białek bakterii odpowiedzialnych za parodontozę
2012/04/A/NZ1/00051
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ6_4: Bakteriologia
- NZ1_2: Biochemia
- NZ1_1: Biologia molekularna
Panel
NZ1 – Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca
Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 8
Konkurs
MAESTRO 2 – ogłoszony 2011-12-15
- Przyznana kwota
- 2 981 498 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2012-09-04
- Zakończenie projektu
- 2017-09-03
- Planowany czas trwania projektu
- 60 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Constans System. Za kwotę 150 000 PLN
- Komora beztlenowa Whitley A 85 Anaerobic Workstation.
- System do analizy ekspresji genów. Za kwotę 450 000 PLN
- Termocykler 96 dołkowy.
- Termocykler PCR gradientowy. Za kwotę 35 000 PLN
- Termocykler PCR wieloblokowy. Za kwotę 35 000 PLN
- Wirówka laboratoryjna z chłodzeniem. Za kwotę 52 572 PLN
- Wytrząsarka hodowlana wraz z kompletem uchwytów (2 szt.). Za kwotę 12 000 PLN
- Wytrząsarka ze stabilizacją temperatury.
- Wytwornica lodu. Za kwotę 20 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (21)
-
KLIKK proteases of Tannerella forsythia: putative virulence factors with a unique domain structure.
- Autorzy:
- Ksiazek M, Mizgalska D, Eick S, Thøgersen IB, Enghild JJ, Potempa J
- Czasopismo:
- Frontiers in Microbiology (rok: 2015, tom: 6, strony: 312), Wydawca: Open Access Frontiers
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fmicb.2015.00312 – link do publikacji
-
Sequence-independent processing site of the C-terminal domain (CTD) influences maturation of the RgpB protease from Porphyromonas gingivalis
- Autorzy:
- Zhou XY, Gao JL, Hunter N, Potempa J, Nguyen KA.
- Czasopismo:
- Mol Microbiol. 2013 Sep;89(5):. doi: (rok: 2013, tom: 89, strony: 903-917), Wydawca: John Wiley & Sons Ltd
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1111/mmi.12319 – link do publikacji
-
Inhibition of gingipains by their profragments as the mechanism protecting Porphyromonas gingivalis against premature activation of secreted proteases.
- Autorzy:
- Veillard F, Sztukowska M, Mizgalska D, Ksiazek M, Houston J, Potempa B, Enghild JJ, Thogersen IB, Gomis-Rüth FX, Nguyen KA, Potempa J.
- Czasopismo:
- Biochim Biophys Acta (rok: 2013, tom: 1830, strony: 4218-4228), Wydawca: Elsvier B.V.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.bbagen.2013.04.005 – link do publikacji
-
A Metalloproteinase Mirolysin of Tannerella forsythia Inhibits All Pathways of the Complement System.
- Autorzy:
- Jusko M, Potempa J, Mizgalska D, Bielecka E, Ksiazek M, Riesbeck K, Garred P, Eick S, Blom AM
- Czasopismo:
- Journal of Immunology (rok: 2015, tom: 195, strony: 2231-2240), Wydawca: The American Association of Immunologists, Inc.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.4049/jimmunol.1402892 – link do publikacji
-
Structure and mechanism of a bacterial host-protein citrullinating virulence factor, Porphyromonas gingivalis peptidylarginine deiminase.
- Autorzy:
- Goulas T, Mizgalska D, Garcia-Ferrer I, Kantyka T, Guevara T, Szmigielski B, Sroka A, Millán C, Usón I, Veillard F, Potempa B, Mydel P, Solà M, Potempa J, Gomis-Rüth FX
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2015, tom: 5, strony: 11969), Wydawca: Nature Publishing Group
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/srep11969 – link do publikacji
-
Porphyromonas gingivalis virulence factor gingipain RgpB shows a unique zymogenic mechanism for cysteine peptidases.
- Autorzy:
- de Diego I, Veillard FT, Guevara T, Potempa B, Sztukowska M, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
- Czasopismo:
- J. Biol. Chem. (rok: 2013, tom: 288, strony: 14287-14296), Wydawca: ASBMB
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M112.444927 – link do publikacji
-
The Type IX Secretion System (T9SS): Highlights and Recent Insights into Its Structure and Function.
- Autorzy:
- Lasica AM, Ksiazek M, Madej M, Potempa J.
- Czasopismo:
- Front Cell Infect Microbiol. (rok: 2017, tom: 7, strony: 215), Wydawca: www.frointierson.org
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fcimb.2017.00215 – link do publikacji
-
Role of OmpA2 surface regions of Porphyromonas gingivalis in host-pathogen interactions with oral epithelial cells.
- Autorzy:
- Naylor KL, Widziolek M, Hunt S, Conolly M, Hicks M, Stafford P, Potempa J, Murdoch C, Douglas CW, Stafford GP.
- Czasopismo:
- Microbiologyopen (rok: 2017, tom: 6, strony: e00401), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/mbo3.401 – link do publikacji
-
Structure of the catalytic domain of the Tannerella forsythia matrix metallopeptidase karilysin in complex with a tetrapeptidic inhibitor.
- Autorzy:
- Guevara T, Ksiazek M, Skottrup PD, Cerdà-Costa N, Trillo-Muyo S, de Diego I, Riise E, Potempa J, Gomis-Rüth FX
- Czasopismo:
- Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun (rok: 2013, tom: 69, strony: 472-476), Wydawca: International Union of Crystallography
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1107/S1744309113007392 – link do publikacji
-
A structure-derived snap-trap mechanism of a multispecific serpin from the dysbiotic human oral microbiome.
- Autorzy:
- Goulas T, Ksiazek M, Garcia-Ferrer I, Sochaj-Gregorczyk AM, Waligorska I, Wasylewski M, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
- Czasopismo:
- J. Biol. Chem. (rok: 2017, tom: 292, strony: 10883-10898), Wydawca: ASBMB
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M117.786533 – link do publikacji
-
Structural and functional probing of PorZ, an essential bacterial surface component of the type-IX secretion system of human oral-microbiomic Porphyromonas gingivalis.
- Autorzy:
- Lasica AM, Goulas T, Mizgalska D, Zhou X, de Diego I, Ksiazek M, Madej M, Guo Y, Guevara T, Nowak M, Potempa B, Goel A, Sztukowska M, Prabhakar AT, Bzowska M, Widziolek M, Thøgersen IB, Enghild JJ, Simonian M, Kulczyk AW, Nguyen KA, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 37708), Wydawca: Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/srep37708 – link do publikacji
-
The outer-membrane export signal of Porphyromonas gingivalis type IX secretion system (T9SS) is a conserved C-terminal β-sandwich domain.
- Autorzy:
- de Diego I, Ksiazek M, Mizgalska D, Koneru L, Golik P, Szmigielski B, Nowak M, Nowakowska Z, Potempa B, Houston JA, Enghild JJ, Thøgersen IB, Gao J, Kwan AH, Trewhella J, Dubin G, Gomis-Rüth FX, Nguyen KA, Potempa J.
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 23123), Wydawca: Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/srep23123 – link do publikacji
-
Calcium Regulates the Activity and Structural Stability of Tpr, a Bacterial Calpain-like Peptidase
- Autorzy:
- Staniec D, Ksiazek M, Thøgersen IB, Enghild JJ, Sroka A, Bryzek D, Bogyo M, Abrahamson M, Potempa J
- Czasopismo:
- Journal of Biological Chemistry (rok: 2015, tom: 290, strony: 27248-27260), Wydawca: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M115.648782 – link do publikacji
-
Structure of RagB, a major immunodominant outer-membrane surface receptor antigen of Porphyromonas gingivalis.
- Autorzy:
- Goulas T, Garcia-Ferrer I, Hutcherson JA, Potempa BA, Potempa J, Scott DA, Xavier Gomis-Rüth F.
- Czasopismo:
- Molecular Oral Microbiology (rok: 2016, tom: 31, strony: 472-485), Wydawca: John Wiley & Sons
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1111/omi.12140 – link do publikacji
-
Zebrafish as a new model to study effects of periodontal pathogens on cardiovascular diseases.
- Autorzy:
- Widziolek M, Prajsnar TK, Tazzyman S, Stafford GP, Potempa J, Murdoch C.
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 36023), Wydawca: Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/srep36023 – link do publikacji
-
Mirolase, a novel subtilisin-like serine protease from the periodontopathogen Tannerella forsythia
- Autorzy:
- Ksiazek M, Karim AY, Bryzek D, Enghild JJ, Thøgersen IB, Koziel J, Potempa J.
- Czasopismo:
- Biol Chem. (rok: 2015, tom: 396, strony: 261-275), Wydawca: degruyter
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1515/hsz-2014-0256 – link do publikacji
-
The S-layer proteins of Tannerella forsythia are secreted via a type IX secretion system that is decoupled from protein O-glycosylation.
- Autorzy:
- Tomek MB, Neumann L, Nimeth I, Koerdt A, Andesner P, Messner P, Mach L, Potempa JS, Schäffer C.
- Czasopismo:
- Mol Oral Biol (rok: 2014, tom: 29, strony: 307-320), Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1111/omi.12062 – link do publikacji
-
Purification and characterisation of recombinant His-tagged RgpB gingipain from Porphymonas gingivalis.
- Autorzy:
- Veillard F, Potempa B, Guo Y, Ksiazek M, Sztukowska MN, Houston JA, Koneru L, Nguyen KA, Potempa J
- Czasopismo:
- Biological Chemistry (rok: 2015, tom: 396, strony: 377-384), Wydawca: De Gruyter
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1515/hsz-2014-0304. – link do publikacji
-
A novel mechanism of latency in matrix metalloproteinases.
- Autorzy:
- López-Pelegrín M, Ksiazek M, Karim AY, Guevara T, Arolas JL, Potempa J, Gomis-Rüth FX
- Czasopismo:
- J Biol Chem (rok: 2015, tom: 290, strony: 4728-4740), Wydawca: ASBMB
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M114.605956 – link do publikacji
-
Structure and mechanism of cysteine peptidase Kgp, a major virulence factor of Porphyromonas gingivalis in periodontitis.
- Autorzy:
- de Diego I, Veillard F, Sztukowska MN, Guevara T, Potempa B, Pomowski A, Huntington JA, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
- Czasopismo:
- J Biol Chem (rok: 2014, tom: 289, strony: 32291-32302), Wydawca: ASMBM
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1074/jbc.M114.602052 – link do publikacji
-
Genome sequence of Porphyromonas gingivalis strain HG66 (DSM 28984)
- Autorzy:
- Siddiqui, H., Yoder-Himes, D., Mizgalska, D., Nguyen, K.A., Potempa, J., and Olsen, I.
- Czasopismo:
- Genome Announcement (GenomeA) (rok: 2014, tom: 2, strony: e00947-14), Wydawca: ASM
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1128/genomeA.00947-14 – link do publikacji