Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Unikatowy system sekrecji białek bakterii odpowiedzialnych za parodontozę

2012/04/A/NZ1/00051

Słowa kluczowe:

p. gingivalis system sekrecji PerioGate wirulencja

Deskryptory:

  • NZ6_4: Bakteriologia
  • NZ1_2: Biochemia
  • NZ1_1: Biologia molekularna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Jan Potempa 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: MAESTRO 2 - ogłoszony 2011-12-15

Przyznana kwota: 2 981 498 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-09-04

Zakończenie projektu: 2017-09-03

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Constans System. Za kwotę 150 000 PLN
  2. Komora beztlenowa Whitley A 85 Anaerobic Workstation.
  3. System do analizy ekspresji genów. Za kwotę 450 000 PLN
  4. Termocykler PCR wieloblokowy. Za kwotę 35 000 PLN
  5. Wytrząsarka ze stabilizacją temperatury.
  6. Termocykler 96 dołkowy.
  7. Termocykler PCR gradientowy. Za kwotę 35 000 PLN
  8. Wirówka laboratoryjna z chłodzeniem. Za kwotę 52 572 PLN
  9. Wytwornica lodu. Za kwotę 20 000 PLN
  10. Wytrząsarka hodowlana wraz z kompletem uchwytów (2 szt.). Za kwotę 12 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (22)
  1. A novel mechanism of latency in matrix metalloproteinases.
    Autorzy:
    López-Pelegrín M, Ksiazek M, Karim AY, Guevara T, Arolas JL, Potempa J, Gomis-Rüth FX
    Czasopismo:
    J Biol Chem (rok: 2015, tom: 290, strony: 4728-4740), Wydawca: ASBMB
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M114.605956 - link do publikacji
  2. Mirolase, a novel subtilisin-like serine protease from the periodontopathogen Tannerella forsythia
    Autorzy:
    Ksiazek M, Karim AY, Bryzek D, Enghild JJ, Thøgersen IB, Koziel J, Potempa J.
    Czasopismo:
    Biol Chem. (rok: 2015, tom: 396, strony: 261-275), Wydawca: degruyter
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1515/hsz-2014-0256 - link do publikacji
  3. Structure and mechanism of cysteine peptidase Kgp, a major virulence factor of Porphyromonas gingivalis in periodontitis.
    Autorzy:
    de Diego I, Veillard F, Sztukowska MN, Guevara T, Potempa B, Pomowski A, Huntington JA, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
    Czasopismo:
    J Biol Chem (rok: 2014, tom: 289, strony: 32291-32302), Wydawca: ASMBM
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M114.602052 - link do publikacji
  4. Zebrafish as a new model to study effects of periodontal pathogens on cardiovascular diseases.
    Autorzy:
    Widziolek M, Prajsnar TK, Tazzyman S, Stafford GP, Potempa J, Murdoch C.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 36023), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep36023 - link do publikacji
  5. Genome sequence of Porphyromonas gingivalis strain HG66 (DSM 28984)
    Autorzy:
    Siddiqui, H., Yoder-Himes, D., Mizgalska, D., Nguyen, K.A., Potempa, J., and Olsen, I.
    Czasopismo:
    Genome Announcement (GenomeA) (rok: 2014, tom: 2, strony: e00947-14), Wydawca: ASM
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1128/genomeA.00947-14 - link do publikacji
  6. Inhibition of gingipains by their profragments as the mechanism protecting Porphyromonas gingivalis against premature activation of secreted proteases.
    Autorzy:
    Veillard F, Sztukowska M, Mizgalska D, Ksiazek M, Houston J, Potempa B, Enghild JJ, Thogersen IB, Gomis-Rüth FX, Nguyen KA, Potempa J.
    Czasopismo:
    Biochim Biophys Acta (rok: 2013, tom: 1830, strony: 4218-4228), Wydawca: Elsvier B.V.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagen.2013.04.005 - link do publikacji
  7. Porphyromonas gingivalis virulence factor gingipain RgpB shows a unique zymogenic mechanism for cysteine peptidases.
    Autorzy:
    de Diego I, Veillard FT, Guevara T, Potempa B, Sztukowska M, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
    Czasopismo:
    J. Biol. Chem. (rok: 2013, tom: 288, strony: 14287-14296), Wydawca: ASBMB
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M112.444927 - link do publikacji
  8. Purification and characterisation of recombinant His-tagged RgpB gingipain from Porphymonas gingivalis.
    Autorzy:
    Veillard F, Potempa B, Guo Y, Ksiazek M, Sztukowska MN, Houston JA, Koneru L, Nguyen KA, Potempa J
    Czasopismo:
    Biological Chemistry (rok: 2015, tom: 396, strony: 377-384), Wydawca: De Gruyter
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1515/hsz-2014-0304. - link do publikacji
  9. Structure and mechanism of a bacterial host-protein citrullinating virulence factor, Porphyromonas gingivalis peptidylarginine deiminase.
    Autorzy:
    Goulas T, Mizgalska D, Garcia-Ferrer I, Kantyka T, Guevara T, Szmigielski B, Sroka A, Millán C, Usón I, Veillard F, Potempa B, Mydel P, Solà M, Potempa J, Gomis-Rüth FX
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2015, tom: 5, strony: 11969), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep11969 - link do publikacji
  10. The S-layer proteins of Tannerella forsythia are secreted via a type IX secretion system that is decoupled from protein O-glycosylation.
    Autorzy:
    Tomek MB, Neumann L, Nimeth I, Koerdt A, Andesner P, Messner P, Mach L, Potempa JS, Schäffer C.
    Czasopismo:
    Mol Oral Biol (rok: 2014, tom: 29, strony: 307-320), Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/omi.12062 - link do publikacji
  11. The Type IX Secretion System (T9SS): Highlights and Recent Insights into Its Structure and Function.
    Autorzy:
    Lasica AM, Ksiazek M, Madej M, Potempa J.
    Czasopismo:
    Front Cell Infect Microbiol. (rok: 2017, tom: 7, strony: 215), Wydawca: www.frointierson.org
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fcimb.2017.00215 - link do publikacji
  12. The outer-membrane export signal of Porphyromonas gingivalis type IX secretion system (T9SS) is a conserved C-terminal β-sandwich domain.
    Autorzy:
    de Diego I, Ksiazek M, Mizgalska D, Koneru L, Golik P, Szmigielski B, Nowak M, Nowakowska Z, Potempa B, Houston JA, Enghild JJ, Thøgersen IB, Gao J, Kwan AH, Trewhella J, Dubin G, Gomis-Rüth FX, Nguyen KA, Potempa J.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 23123), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep23123 - link do publikacji
  13. Sequence-independent processing site of the C-terminal domain (CTD) influences maturation of the RgpB protease from Porphyromonas gingivalis
    Autorzy:
    Zhou XY, Gao JL, Hunter N, Potempa J, Nguyen KA.
    Czasopismo:
    Mol Microbiol. 2013 Sep;89(5):. doi: (rok: 2013, tom: 89, strony: 903-917), Wydawca: John Wiley & Sons Ltd
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/mmi.12319 - link do publikacji
  14. Structural and functional probing of PorZ, an essential bacterial surface component of the type-IX secretion system of human oral-microbiomic Porphyromonas gingivalis.
    Autorzy:
    Lasica AM, Goulas T, Mizgalska D, Zhou X, de Diego I, Ksiazek M, Madej M, Guo Y, Guevara T, Nowak M, Potempa B, Goel A, Sztukowska M, Prabhakar AT, Bzowska M, Widziolek M, Thøgersen IB, Enghild JJ, Simonian M, Kulczyk AW, Nguyen KA, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 37708), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep37708 - link do publikacji
  15. Structure of RagB, a major immunodominant outer-membrane surface receptor antigen of Porphyromonas gingivalis.
    Autorzy:
    Goulas T, Garcia-Ferrer I, Hutcherson JA, Potempa BA, Potempa J, Scott DA, Xavier Gomis-Rüth F.
    Czasopismo:
    Molecular Oral Microbiology (rok: 2016, tom: 31, strony: 472-485), Wydawca: John Wiley & Sons
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/omi.12140 - link do publikacji
  16. Structure of the catalytic domain of the Tannerella forsythia matrix metallopeptidase karilysin in complex with a tetrapeptidic inhibitor.
    Autorzy:
    Guevara T, Ksiazek M, Skottrup PD, Cerdà-Costa N, Trillo-Muyo S, de Diego I, Riise E, Potempa J, Gomis-Rüth FX
    Czasopismo:
    Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun (rok: 2013, tom: 69, strony: 472-476), Wydawca: International Union of Crystallography
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1107/S1744309113007392 - link do publikacji
  17. Role of OmpA2 surface regions of Porphyromonas gingivalis in host-pathogen interactions with oral epithelial cells.
    Autorzy:
    Naylor KL, Widziolek M, Hunt S, Conolly M, Hicks M, Stafford P, Potempa J, Murdoch C, Douglas CW, Stafford GP.
    Czasopismo:
    Microbiologyopen (rok: 2017, tom: 6, strony: e00401), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/mbo3.401 - link do publikacji
  18. A Metalloproteinase Mirolysin of Tannerella forsythia Inhibits All Pathways of the Complement System.
    Autorzy:
    Jusko M, Potempa J, Mizgalska D, Bielecka E, Ksiazek M, Riesbeck K, Garred P, Eick S, Blom AM
    Czasopismo:
    Journal of Immunology (rok: 2015, tom: 195, strony: 2231-2240), Wydawca: The American Association of Immunologists, Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4049/jimmunol.1402892 - link do publikacji
  19. A structure-derived snap-trap mechanism of a multispecific serpin from the dysbiotic human oral microbiome.
    Autorzy:
    Goulas T, Ksiazek M, Garcia-Ferrer I, Sochaj-Gregorczyk AM, Waligorska I, Wasylewski M, Potempa J, Gomis-Rüth FX.
    Czasopismo:
    J. Biol. Chem. (rok: 2017, tom: 292, strony: 10883-10898), Wydawca: ASBMB
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M117.786533 - link do publikacji
  20. Calcium Regulates the Activity and Structural Stability of Tpr, a Bacterial Calpain-like Peptidase
    Autorzy:
    Staniec D, Ksiazek M, Thøgersen IB, Enghild JJ, Sroka A, Bryzek D, Bogyo M, Abrahamson M, Potempa J
    Czasopismo:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2015, tom: 290, strony: 27248-27260), Wydawca: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M115.648782 - link do publikacji
  21. KLIKK proteases of Tannerella forsythia: putative virulence factors with a unique domain structure.
    Autorzy:
    Ksiazek M, Mizgalska D, Eick S, Thøgersen IB, Enghild JJ, Potempa J
    Czasopismo:
    Frontiers in Microbiology (rok: 2015, tom: 6, strony: 312), Wydawca: Open Access Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2015.00312 - link do publikacji
  22. The essential Porphyromonas gingivalis type IX secretion system component PorZ delivers anionic-lipopolysaccharide to the PorU sortase for transpeptidase processing of cargos
    Autorzy:
    Mariusz Madej, Zuzanna Nowakowska, Miroslaw Ksiazek, Anna M. Lasica, Danuta Mizgalska, Magdalena Nowak, Anna Jacula, Carsten Scaveniusd, Jan J. Enghild, Joseph Aduse-Opoku, Michael A. Curtis, F. Xavier Gomis-Rüth, and Jan Potempa
    Czasopismo:
    mBio , Wydawca: ASM
    Status:
    Złożona