Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Kombinatoryczna biblioteka substratów fluorogenicznych zawierająca naturalne / nienaturalne aminokwasy do profilowania specyficzności substratowej kaspaz.

2011/03/B/ST5/01048

Słowa kluczowe:

kaspaza substrat chemia kombinatoryczna

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Politechnika Wrocławska, Wydział Chemiczny

woj. dolnośląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Marcin Drąg 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: OPUS 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 830 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-08-01

Zakończenie projektu: 2015-08-28

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Wyparka rotacyjna z pompą mebranową. Za kwotę 19 980 PLN
  2. Zestaw do chromatografii HPLC i komputer sterujący.
  3. Liofilizator. Za kwotę 50 000 PLN
  4. Spektorfluorymetr płytkowy.
  5. Robot do syntezy peptydów na nośniku stałym. Za kwotę 280 000 PLN
  6. Zamrażarka.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (5)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Unnatural amino acids increase sensitivity and provide for the design of highly selective caspase substrates
    Autorzy:
    Marcin Poręba, Paulina Kasperkiewicz, Scott J. Snipas, Domenico Fasci, Guy S. Salvesen, Marcin Drąg
    Czasopismo:
    Cell Death and Differentiation (rok: 2014, tom: 9, strony: 1482-92), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/cdd.2014.64. - link do publikacji
  2. Caspase substrates and inhibitors
    Autorzy:
    Marcin Poręba, Aleksandra Stróżyk, Guy S. Salvesen, Marcin Drąg
    Czasopismo:
    Cold Spring Harbor Perspectives in Biology (rok: 2013, tom: 45505, strony: 45311), Wydawca: Cold Spring Harbor Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1101/cshperspect.a008680 - link do publikacji
  3. Substrate Specificity and Possible Heterologous Targets of Phytaspase, a Plant Cell Death Protease
    Autorzy:
    Raisa A. Galiullina, Paulina Kasperkiewicz, Nina V. Chichkova, Aleksandra Szalek, Marina V. Serebryakova, Marcin Poreba, Marcin Drag, and Andrey B. Vartapetian
    Czasopismo:
    The Journal of Biological Chemistry (rok: 2015, tom: 290, strony: 24806–24815), Wydawca: AMER SOC BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY INC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.M115.675819 - link do publikacji
  4. Small Molecule Active Site Directed Tools for Studying Human Caspases
    Autorzy:
    Marcin Poręba, Aleksandra Szalek, Paulina Kasperkiewicz, Wioletta Rut, Guy S. Salvesen, Marcin Drąg
    Czasopismo:
    Chemical Reviews (rok: 2015, tom: 115 (22), strony: 12546–12629), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.chemrev.5b00434 - link do publikacji
  5. Recent advances and concepts in substrate specificity determination of proteases using tailored libraries of fluorogenic substrates with unnatural amino acids.
    Autorzy:
    Wioletta Rut , Paulina Kasperkiewicz, Anna Byzia, Marcin Poręba, Katarzyna Groborz, Marcin Drag
    Czasopismo:
    Biological Chemistry (rok: 2015, tom: 396, strony: 329–337), Wydawca: De Gruyter
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1515/hsz-2014-0315 - link do publikacji
  1. New and Sensitive Donor/Acceptor Pair for Internally Quenched Fluorescent Peptide Substrates of Proteases
    Autorzy:
    Aleksandra Stróżyk, Marcin Poręba, Wioletta Rut, Paulina Kasperkiewicz, Scott Snipas, Guy S. Salvesen, Christopher Overall, Marko Mihelic, Dusan Turk, Marcin Drąg
    Konferencja:
    22nd Polish Peptide Symposium (rok: 2013, ), Wydawca: Oficyna Wydawnicza Politechniki Wrocławskiej
    Data:
    konferencja 1-5 września
    Status:
    Opublikowana
  2. Unnatural amino acids provide for the design of highly selective substrates for caspases and legumain
    Autorzy:
    23.Marcin Poręba, Paulina Kasperkiewicz, Wioletta Rut, Scott J. Snipas, Dusan Turk, Guy S. Salvesen, Marcin Drąg
    Konferencja:
    Pacific Coast Protease Spring School (rok: 2014, ), Wydawca: książka abstraktowa z konferencji
    Data:
    konferencja 29.04.-02.05.2014
    Status:
    Opublikowana
  3. The use of unnatural amino acids in peptide fluorogenic substrates reveals unexpected active site preferences of human caspases and legumain"
    Autorzy:
    Marcin Poręba, Paulina Kasperkiewicz, Wioletta Rut, Scott Snipas, Marko Mihelic, Dusan Turk, Guy S. Salvesen, Marcin Drąg
    Konferencja:
    THE 8TH GENERAL MEETING OF THE INTERNATIONAL PROTEOLYSIS SOCIETY (rok: 2013, ), Wydawca: INTERNATIONAL PROTEOLYSIS SOCIETY
    Data:
    konferencja 20 - 24 października 2013
    Status:
    Opublikowana
  1. Positional Scanning Substrate Combinatorial Library (PS-SCL) Approach to Define Caspase Substrate Specificity
    Autorzy:
    Marcin Poręba, Aleksandra Szalek, Paulina Kasperkiewicz, Marcin Drąg
    Książka:
    Methods in Molecular Biology (rok: 2014, tom: 1133, strony: 41-59), Wydawca: Clifton, N.J. : Humana Press
    Status:
    Opublikowana