Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza białkowych profili masowych uzyskiwanych z użyciem spektrometrii MALDI-ToF w celu wykrycia sygnatur nowotworowych

2011/01/N/NZ2/04813

Słowa kluczowe:

MALDI-ToF przetwarzanie danych biologicznych klasyfikacja sygnatura nowotworowa

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_3: Proteomika
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Michał Marczyk 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 94 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-07

Zakończenie projektu: 2013-12-06

Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Wysokowydajnościowa karta graficzna. Za kwotę 18 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (1)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (6)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Initializing the EM Algorithm for Univariate Gaussian, Multi-Component, Heteroscedastic Mixture Models by Dynamic Programming Partitions
    Autorzy:
    A.Polański, M.Marczyk, M.Pietrowska, P.Widlak, J.Polanska
    Czasopismo:
    International Journal of Computational Methods (rok: 2018, tom: 15, strony: 1850012), Wydawca: World Scientific
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1142/S0219876218500123 - link do publikacji
  1. Batch effect detection methods in microarray data
    Autorzy:
    A.Molencka, M.Marczyk, J.Polańska
    Konferencja:
    XVth Gliwice Scientific Meetings (rok: 2011, ), Wydawca: Centrum Onkologii w Gliwicach
    Data:
    konferencja 18-19.11.2011
    Status:
    Opublikowana
  2. Improving Peak Detection by Gaussian Mixture Modeling of Mass Spectral Signal
    Autorzy:
    M.Marczyk, A.Polański, J.Polańska
    Konferencja:
    3rd International Conference on Frontiers of Signal Processing (ICFSP 2017) (rok: 2017, ), Wydawca: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
    Data:
    konferencja 6-8.09
    Status:
    Opublikowana
  3. A parallel implementation of MALDI-ToF spectra modeling on Cuda-enabled graphics hardware
    Autorzy:
    M.Marczyk, J.Polańska, A.Polański
    Konferencja:
    XVIIth Gliwice Scientific Meetings (rok: 2013, ), Wydawca: Centrum Onkologii w Gliwicach
    Data:
    konferencja 15-16.11.2013 r.
    Status:
    Opublikowana
  4. Automatic post-processing of Gaussian spectral components in MALDI-ToF data analysis
    Autorzy:
    M.Marczyk, J. Polańska, A. Polański
    Konferencja:
    Bioinformatics in Toruń (rok: 2012, ), Wydawca: nie dotyczy
    Data:
    konferencja 27-29.09.2012 r.
    Status:
    Opublikowana
  5. Detection and quantification of MALDI-ToF spectral peaks by using Gaussian mixture decomposition
    Autorzy:
    M.Marczyk, A.Polański, J.Polańska
    Konferencja:
    XVIth Gliwice Scientific Meetings (rok: 2012, ), Wydawca: Centrum Onkologii w Gliwicach
    Data:
    konferencja 16-17.11.2012 r.
    Status:
    Opublikowana
  6. Peak detection by Gaussian mixture modeling of MALDI-ToF spectra for proteome profiling
    Autorzy:
    M.Marczyk, J.Polańska, A.Polański
    Konferencja:
    ISMB/ECCB 2013 (rok: 2013, ), Wydawca: nie dotyczy
    Data:
    konferencja 21-23.07.2013 r.
    Status:
    Opublikowana
  1. Comparison of algorithms for Profile-Based Alignment of low resolutions MALDI-ToF Spectra
    Autorzy:
    M.Marczyk, J.Polańska, A.Polański
    Książka:
    Man Machine Interactions (rok: 2014, tom: 3, strony: 193-201), Wydawca: Springer International Publishing
    Status:
    Opublikowana