Badania fizykochemiczne i strukturalne nad wpływem naładowanych reszt aminokwasowych na tworzenie zwrotów oraz stabilizowanie struktury beta w białkach.

2011/01/D/ST4/04497

Słowa kluczowe

Deskryptory

  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa

Panel

ST4 – Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki »

Kierownik projektu (z jednostki realizującej)

dr Joanna Makowska

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs

SONATA 1 – ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota
196 150 PLN
Rozpoczęcie projektu
2011-12-01
Zakończenie projektu
2014-11-30
Planowany czas trwania projektu
36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu
Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Drukarka laserowa. Za kwotę 1 000 PLN
  2. Dysk przenośny. Za kwotę 500 PLN
  3. Komputer. Za kwotę 4 000 PLN
  4. Notebook do zestawu do miareczkowania oraz oprogramowanie (Program Cerkolab). Za kwotę 4 000 PLN
  5. Przystawka do DSC. Za kwotę 5 000 PLN
  6. Termostat z chłodzeniem Advanced 7L Low-Prof.. Za kwotę 5 925 PLN
  7. Zestaw komputerowy.
  8. Zestaw pomiarowy do miareczkowania potencjometrycznego Mikrotitrator CLS (Cerko). Za kwotę 25 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

Publikacje w czasopismach (7)

  1. Thermodynamics of the protonation equilibria of two fragments of N-terminal beta-hairpin of FPB28 WW domain

    Autorzy:
    Joanna Makowska, Dorota Uber, and Lech Chmurzynski
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2012, tom: 116, strony: 653-659), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1021/jp209844v – link do publikacji
  2. A Study of the Influence of Charged Residues on b-Hairpin Formation by Nuclear Magnetic Resonance and Molecular Dynamics

    Autorzy:
    J. Makowska, W. Żmudzińska, D. Uber, L. Chmurzyński
    Czasopismo:
    The Protein Journal (rok: 2014, tom: 33, strony: 525–535), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1007/s10930-014-9585-7 – link do publikacji
  3. Preliminary Studies on Trigonelline as Potential Anti-Alzheimer Disease Agent: Determination by Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography and Modeling of Interactions with Beta-Amyloid

    Autorzy:
    Joanna Makowska, Damian Szczęsny, Agnieszka Lichucka, Artur Giełdoń, Lech Chmurzyński, Roman Kaliszan
    Czasopismo:
    Journal of Chromatography B (rok: 2014, tom: 1, strony: 101-104), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.jchromb.2013.12.001 – link do publikacji
  4. Influence of the length of the alanine spacer on the acidic-basic properties of the Ac- Lys-(Ala)n-Lys-NH2 peptides (n=0, 1, 2,.., 5)

    Autorzy:
    Joanna Makowska, Adam Liwo, Lech Chmurzyński, Harold A. Scheraga
    Czasopismo:
    Journal of Solution Chemistry (rok: 2012, tom: 41, strony: 1738–1746), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1007/s10953-012-9903-7 – link do publikacji
  5. Like-Charged Residues at the Ends of Oligoalanine Sequences Might Induce a Chain Reversal

    Autorzy:
    Joanna Makowska, Adam Liwo, Wioletta Żmudzińska, Agnieszka Lewandowska, Lech Chmurzyński, Harold A. Scheraga
    Czasopismo:
    Biopolymers (rok: 2012, tom: 97, strony: 240-249), Wydawca: Wiley Periodicals, Inc.
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1002/bip.22013 – link do publikacji
  6. Studies of conformational preferences of derivatives fragments of protein G (1IGD) using temperature dependent potentiometric titration methodology

    Autorzy:
    Joanna Makowska, Dorota Uber, Dagmara Lubowiecka, Lech Chmurzyński
    Czasopismo:
    The Journal of Chemical Thermodynamics (rok: 2014, tom: 70, strony: 88-94), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    DOI:
    10.1016/j.jct.2013.10.029 – link do publikacji
  7. Thermodynamical studies of the example peptide containing metaaminobenzoic acid (MABA) which promotes bends in proteins

    Autorzy:
    J. Makowska, D. Uber, L. Chmurzyński
    Status:
    Przyjęta do publikacji

Publikacje książkowe (2)

  1. Conformational analysis of the fragment of the human Pin1 WW domain: the influence of charged amino-acid residues on the β-hairpin structure

    Autorzy:
    J. Makowska, D. Uber, W. Żmudzińska, L. Chmurzyński
    Książka:
    TASK Quarterly - CBSB 2014 special issue (rok: 2014, tom: 18, strony: 217-223), Wydawca: Academic Computer Centre in Gdansk
    Status:
    Opublikowana
  2. Wpływ naładowanych reszt aminokwasowych na strukturę beta w białkach

    Autorzy:
    Dorota Uber, Joanna Makowska, Lech Chmurzyński
    Książka:
    Na pograniczu chemii i biologii (rok: 2013, tom: XXXI, strony: 137-145), Wydawca: Wydawnictwo naukowe UAM
    Status:
    Opublikowana

« Nowe wyszukiwanie

Projekt graficzny i wykonanie: Jakub Piotrowski