Badania fizykochemiczne i strukturalne nad wpływem naładowanych reszt aminokwasowych na tworzenie zwrotów oraz stabilizowanie struktury beta w białkach.
2011/01/D/ST4/04497
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
- ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
Panel
ST4 – Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii
woj. pomorskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs
SONATA 1 – ogłoszony 2011-03-15
- Przyznana kwota
- 196 150 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2011-12-01
- Zakończenie projektu
- 2014-11-30
- Planowany czas trwania projektu
- 36 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Drukarka laserowa. Za kwotę 1 000 PLN
- Dysk przenośny. Za kwotę 500 PLN
- Komputer. Za kwotę 4 000 PLN
- Notebook do zestawu do miareczkowania oraz oprogramowanie (Program Cerkolab). Za kwotę 4 000 PLN
- Przystawka do DSC. Za kwotę 5 000 PLN
- Termostat z chłodzeniem Advanced 7L Low-Prof.. Za kwotę 5 925 PLN
- Zestaw komputerowy.
- Zestaw pomiarowy do miareczkowania potencjometrycznego Mikrotitrator CLS (Cerko). Za kwotę 25 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (7)
-
Thermodynamics of the protonation equilibria of two fragments of N-terminal beta-hairpin of FPB28 WW domain
- Autorzy:
- Joanna Makowska, Dorota Uber, and Lech Chmurzynski
- Czasopismo:
- The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2012, tom: 116, strony: 653-659), Wydawca: American Chemical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/jp209844v – link do publikacji
-
A Study of the Influence of Charged Residues on b-Hairpin Formation by Nuclear Magnetic Resonance and Molecular Dynamics
- Autorzy:
- J. Makowska, W. Żmudzińska, D. Uber, L. Chmurzyński
- Czasopismo:
- The Protein Journal (rok: 2014, tom: 33, strony: 525–535), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s10930-014-9585-7 – link do publikacji
-
Preliminary Studies on Trigonelline as Potential Anti-Alzheimer Disease Agent: Determination by Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography and Modeling of Interactions with Beta-Amyloid
- Autorzy:
- Joanna Makowska, Damian Szczęsny, Agnieszka Lichucka, Artur Giełdoń, Lech Chmurzyński, Roman Kaliszan
- Czasopismo:
- Journal of Chromatography B (rok: 2014, tom: 1, strony: 101-104), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.jchromb.2013.12.001 – link do publikacji
-
Influence of the length of the alanine spacer on the acidic-basic properties of the Ac- Lys-(Ala)n-Lys-NH2 peptides (n=0, 1, 2,.., 5)
- Autorzy:
- Joanna Makowska, Adam Liwo, Lech Chmurzyński, Harold A. Scheraga
- Czasopismo:
- Journal of Solution Chemistry (rok: 2012, tom: 41, strony: 1738–1746), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s10953-012-9903-7 – link do publikacji
-
Like-Charged Residues at the Ends of Oligoalanine Sequences Might Induce a Chain Reversal
- Autorzy:
- Joanna Makowska, Adam Liwo, Wioletta Żmudzińska, Agnieszka Lewandowska, Lech Chmurzyński, Harold A. Scheraga
- Czasopismo:
- Biopolymers (rok: 2012, tom: 97, strony: 240-249), Wydawca: Wiley Periodicals, Inc.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/bip.22013 – link do publikacji
-
Studies of conformational preferences of derivatives fragments of protein G (1IGD) using temperature dependent potentiometric titration methodology
- Autorzy:
- Joanna Makowska, Dorota Uber, Dagmara Lubowiecka, Lech Chmurzyński
- Czasopismo:
- The Journal of Chemical Thermodynamics (rok: 2014, tom: 70, strony: 88-94), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.jct.2013.10.029 – link do publikacji
-
Thermodynamical studies of the example peptide containing metaaminobenzoic acid (MABA) which promotes bends in proteins
- Autorzy:
- J. Makowska, D. Uber, L. Chmurzyński
- Status:
- Przyjęta do publikacji
Publikacje książkowe (2)
-
Conformational analysis of the fragment of the human Pin1 WW domain: the influence of charged amino-acid residues on the β-hairpin structure
- Autorzy:
- J. Makowska, D. Uber, W. Żmudzińska, L. Chmurzyński
- Książka:
- TASK Quarterly - CBSB 2014 special issue (rok: 2014, tom: 18, strony: 217-223), Wydawca: Academic Computer Centre in Gdansk
- Status:
- Opublikowana
-
Wpływ naładowanych reszt aminokwasowych na strukturę beta w białkach
- Autorzy:
- Dorota Uber, Joanna Makowska, Lech Chmurzyński
- Książka:
- Na pograniczu chemii i biologii (rok: 2013, tom: XXXI, strony: 137-145), Wydawca: Wydawnictwo naukowe UAM
- Status:
- Opublikowana